More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1719 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 172 aa  340  5.999999999999999e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  66.87 
 
 		 170 aa  231  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  65.43 
 
 		 173 aa  214  4e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  62.05 
 
 		 171 aa  198  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  60.71 
 
 		 171 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  55.62 
 
 		 177 aa  192  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  59.04 
 
 		 171 aa  191  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  57.83 
 
 		 171 aa  191  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 		 172 aa  191  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  56.55 
 
 		 173 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  53.01 
 
 		 170 aa  186  9e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 		 171 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  57.74 
 
 		 171 aa  184  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  54.6 
 
 		 176 aa  184  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  56.29 
 
 		 171 aa  184  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  55.42 
 
 		 183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  55.42 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  55.42 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  55.42 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  55.42 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  55.42 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  55.42 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  55.42 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  55.42 
 
 		 183 aa  182  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  55.81 
 
 		 174 aa  181  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 		 170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  51.74 
 
 		 182 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  54.71 
 
 		 181 aa  180  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  54.22 
 
 		 173 aa  180  8.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  51.81 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 		 181 aa  177  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  53.01 
 
 		 182 aa  177  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  53.05 
 
 		 179 aa  177  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  52.12 
 
 		 168 aa  177  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  53.01 
 
 		 175 aa  177  8e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  51.74 
 
 		 182 aa  177  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  53.7 
 
 		 170 aa  177  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 175 aa  177  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 		 171 aa  176  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 179 aa  175  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  52.47 
 
 		 174 aa  176  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  53.57 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  56.21 
 
 		 171 aa  175  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  54.32 
 
 		 171 aa  174  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 		 187 aa  174  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 		 187 aa  174  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  54.27 
 
 		 181 aa  174  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  53.57 
 
 		 181 aa  174  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 		 184 aa  174  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2005  adenine phosphoribosyltransferase  49.08 
 
 		 181 aa  174  8e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00122085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 		 184 aa  174  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  51.81 
 
 		 183 aa  173  9e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  52.98 
 
 		 176 aa  173  9e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  53.01 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  54.27 
 
 		 183 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  52.41 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  50.94 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 		 181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  52.98 
 
 		 172 aa  171  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 		 199 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  53.05 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  52.83 
 
 		 183 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 		 198 aa  170  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  52.83 
 
 		 183 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  51.81 
 
 		 172 aa  170  9e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 		 214 aa  170  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 		 183 aa  170  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 		 186 aa  170  9e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  53.09 
 
 		 197 aa  170  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  52.83 
 
 		 181 aa  169  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  53.01 
 
 		 170 aa  169  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  52.83 
 
 		 183 aa  169  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 		 182 aa  170  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  45.98 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  54.22 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 		 178 aa  168  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  45.78 
 
 		 173 aa  168  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  54.22 
 
 		 172 aa  168  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  54.22 
 
 		 172 aa  168  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 		 172 aa  168  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  52.07 
 
 		 174 aa  167  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 		 184 aa  167  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  53.8 
 
 		 177 aa  167  5e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>