More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1905 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
172 aa  335  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
172 aa  335  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  62.21 
 
 
172 aa  228  4e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  61.05 
 
 
172 aa  223  7e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  62.94 
 
 
170 aa  223  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  58.72 
 
 
172 aa  222  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  65.29 
 
 
170 aa  222  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  61.4 
 
 
173 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  64.12 
 
 
170 aa  218  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  60.82 
 
 
172 aa  215  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  59.06 
 
 
172 aa  210  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  59.06 
 
 
172 aa  210  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  59.06 
 
 
172 aa  207  8e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  61.18 
 
 
182 aa  203  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3124  adenine phosphoribosyltransferase  59.41 
 
 
170 aa  204  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0411014  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 
173 aa  203  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  58.24 
 
 
170 aa  202  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  55.95 
 
 
174 aa  202  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4152  adenine phosphoribosyltransferase  60.59 
 
 
170 aa  200  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4527  adenine phosphoribosyltransferase  60.59 
 
 
170 aa  200  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  58.96 
 
 
171 aa  200  9e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0708  adenine phosphoribosyltransferase  60.59 
 
 
170 aa  200  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  56.14 
 
 
175 aa  199  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4492  adenine phosphoribosyltransferase  60 
 
 
170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4303  adenine phosphoribosyltransferase  60 
 
 
170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4141  adenine phosphoribosyltransferase  60 
 
 
170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4638  adenine phosphoribosyltransferase  60 
 
 
170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4488  adenine phosphoribosyltransferase  60 
 
 
170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160658 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4542  adenine phosphoribosyltransferase  60 
 
 
170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  60.69 
 
 
171 aa  198  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  57.74 
 
 
173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4255  adenine phosphoribosyltransferase  59.41 
 
 
170 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  53.53 
 
 
172 aa  194  7e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
172 aa  193  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  57.56 
 
 
172 aa  193  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1190  adenine phosphoribosyltransferase  53.53 
 
 
172 aa  193  9e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  53.8 
 
 
172 aa  192  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  54.71 
 
 
170 aa  192  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 
172 aa  191  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  56.55 
 
 
176 aa  191  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 
170 aa  192  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 
170 aa  191  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0827  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
175 aa  191  5e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010482  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  58.14 
 
 
172 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  58.14 
 
 
172 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  56.96 
 
 
424 aa  188  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  54.27 
 
 
174 aa  187  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  56.4 
 
 
172 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  56.55 
 
 
176 aa  185  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
187 aa  184  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
187 aa  184  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  55.23 
 
 
172 aa  184  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
183 aa  184  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  55.95 
 
 
174 aa  184  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
187 aa  183  8e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
183 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
183 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
183 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
183 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  56.71 
 
 
183 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
183 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
183 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 
183 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  55.49 
 
 
175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1473  adenine phosphoribosyltransferase  55.7 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
181 aa  181  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 
179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 
170 aa  180  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
177 aa  180  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 
182 aa  179  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  55.23 
 
 
187 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  55.95 
 
 
178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0435  adenine phosphoribosyltransferase  54.71 
 
 
170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0752595 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
197 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1069  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
175 aa  177  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  51.48 
 
 
185 aa  177  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
181 aa  177  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
198 aa  177  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  50.86 
 
 
177 aa  176  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 
171 aa  176  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
214 aa  175  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
180 aa  175  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 
183 aa  174  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
181 aa  174  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
184 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
184 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
184 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
184 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
171 aa  174  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 
185 aa  174  7e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
182 aa  174  7e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
173 aa  173  9e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  54.07 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  54.76 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 
182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  51.74 
 
 
178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>