More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2005 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2005  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00122085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  54.86 
 
 		 175 aa  204  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  52.41 
 
 		 170 aa  174  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  49.08 
 
 		 172 aa  174  9e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  50.63 
 
 		 176 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  46.2 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 		 174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 		 172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 		 175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  45.35 
 
 		 214 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 		 175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  45.62 
 
 		 171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 		 170 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 		 180 aa  162  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  45.66 
 
 		 174 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 		 172 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 		 424 aa  161  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  45.29 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 		 170 aa  158  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 170 aa  158  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 		 177 aa  158  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0545  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 		 173 aa  157  6e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.342183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  45.78 
 
 		 174 aa  157  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 		 172 aa  157  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 		 172 aa  157  8e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  47.24 
 
 		 172 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 		 173 aa  156  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 171 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  42.35 
 
 		 187 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  43.35 
 
 		 181 aa  154  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  42.61 
 
 		 194 aa  155  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  42.35 
 
 		 187 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  44.19 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  42.35 
 
 		 187 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0455  adenine phosphoribosyltransferase  49.37 
 
 		 193 aa  154  6e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00282145  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  42.2 
 
 		 181 aa  154  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 		 184 aa  154  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 		 198 aa  154  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  42.2 
 
 		 181 aa  154  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  42.35 
 
 		 181 aa  154  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  44.25 
 
 		 181 aa  154  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  46.39 
 
 		 172 aa  153  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  48.05 
 
 		 168 aa  153  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  41.28 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 		 179 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  43.53 
 
 		 196 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3739  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0293809  normal  0.608797 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  40.56 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 		 170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 		 171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  45.28 
 
 		 178 aa  151  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  42.68 
 
 		 181 aa  151  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  43.65 
 
 		 179 aa  151  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  43.53 
 
 		 173 aa  151  5e-36  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 		 180 aa  151  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  45.2 
 
 		 176 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 183 aa  150  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 		 181 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  40.56 
 
 		 183 aa  150  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  40.56 
 
 		 183 aa  150  8e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  40.56 
 
 		 183 aa  150  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  40.56 
 
 		 183 aa  150  8e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 		 180 aa  150  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 		 172 aa  150  8e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  40.56 
 
 		 183 aa  150  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  40.56 
 
 		 183 aa  150  8e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  40.56 
 
 		 183 aa  150  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  40.56 
 
 		 183 aa  150  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  43.53 
 
 		 171 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  39.78 
 
 		 185 aa  150  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1118  adenine phosphoribosyltransferase  45.29 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00971568  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  41.28 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 175 aa  149  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  42.68 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3653  adenine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 		 174 aa  148  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  40.59 
 
 		 181 aa  148  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 		 181 aa  148  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 		 193 aa  148  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 		 179 aa  147  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  39.2 
 
 		 184 aa  147  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 		 199 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  43.86 
 
 		 171 aa  147  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  40.8 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.867387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>