More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0841 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
184 aa  357  6e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  68.05 
 
 
176 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  62.42 
 
 
168 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
170 aa  192  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2115  adenine phosphoribosyltransferase  61.18 
 
 
175 aa  192  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00527883  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  53.05 
 
 
182 aa  190  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  61.18 
 
 
172 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  53.8 
 
 
177 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  54.6 
 
 
174 aa  186  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 
185 aa  184  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  55.35 
 
 
185 aa  182  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1339  adenine phosphoribosyltransferase  59.41 
 
 
177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36012  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  61.18 
 
 
185 aa  181  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 
172 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  54.22 
 
 
174 aa  179  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 
172 aa  179  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  49.15 
 
 
187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  49.15 
 
 
187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  54.44 
 
 
175 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 
182 aa  178  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 
198 aa  177  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
176 aa  177  5.999999999999999e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
182 aa  177  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2358  adenine phosphoribosyltransferase  60.34 
 
 
187 aa  177  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
187 aa  177  9e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
172 aa  177  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  51.81 
 
 
170 aa  175  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  53.37 
 
 
170 aa  175  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  52.47 
 
 
172 aa  175  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
183 aa  174  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 
177 aa  174  8e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
172 aa  174  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 
214 aa  174  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0755  Adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 
177 aa  174  9e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
171 aa  174  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 
172 aa  174  9e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  44.58 
 
 
170 aa  173  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  50.3 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1375  adenine phosphoribosyltransferase  58.82 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.801683  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 
177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  48.5 
 
 
173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
171 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
183 aa  171  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0455  adenine phosphoribosyltransferase  53.42 
 
 
193 aa  171  7.999999999999999e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00282145  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  54.9 
 
 
172 aa  170  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0781  adenine phosphoribosyltransferase  46.99 
 
 
172 aa  170  9e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  48.17 
 
 
181 aa  170  9e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  54.49 
 
 
180 aa  170  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  52.1 
 
 
171 aa  170  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
183 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  54.8 
 
 
185 aa  170  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
183 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  52.41 
 
 
172 aa  170  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  52.41 
 
 
172 aa  170  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
183 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
183 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  46.99 
 
 
173 aa  169  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  48.19 
 
 
173 aa  169  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  54.22 
 
 
187 aa  169  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  49.38 
 
 
172 aa  169  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
170 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  47.9 
 
 
172 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 
182 aa  168  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  46.91 
 
 
181 aa  169  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  47.9 
 
 
172 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
183 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
170 aa  168  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  52.47 
 
 
179 aa  168  5e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1118  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 
182 aa  167  7e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00971568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
188 aa  167  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  51.81 
 
 
171 aa  167  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
181 aa  167  9e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 
175 aa  166  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0401  adenine phosphoribosyltransferase  50.9 
 
 
171 aa  166  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1814  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 
188 aa  166  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.068208  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
177 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
178 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  53.5 
 
 
179 aa  166  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 
185 aa  166  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2005  adenine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
181 aa  166  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00122085  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
176 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00395  adenine phosphoribosyltransferase  53.7 
 
 
186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  46.11 
 
 
171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  49.08 
 
 
173 aa  165  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
181 aa  165  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
181 aa  165  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
173 aa  164  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
197 aa  164  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5140  adenine phosphoribosyltransferase  57.23 
 
 
184 aa  164  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016274 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14000  adenine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>