More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_14000 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_14000  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
183 aa  357  4e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
172 aa  167  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
172 aa  164  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
172 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
172 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 
184 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
176 aa  159  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  48 
 
 
174 aa  158  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  50.64 
 
 
172 aa  157  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  50.33 
 
 
176 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  48.88 
 
 
187 aa  156  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  47.9 
 
 
168 aa  156  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  47.19 
 
 
180 aa  155  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 
171 aa  154  6e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17570  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 
177 aa  154  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0869037 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
193 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
170 aa  152  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0827  adenine phosphoribosyltransferase  46.11 
 
 
175 aa  152  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010482  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  49.39 
 
 
214 aa  151  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  44.72 
 
 
176 aa  150  7e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  45.98 
 
 
181 aa  150  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 
197 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1364  adenine phosphoribosyltransferase  48.62 
 
 
178 aa  150  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.647458  normal  0.747385 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1800  adenine phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
192 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160052  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
171 aa  149  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
424 aa  148  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  43.03 
 
 
171 aa  148  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15120  adenine phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
175 aa  148  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  42.2 
 
 
182 aa  148  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  43.68 
 
 
182 aa  148  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  44.97 
 
 
171 aa  147  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1069  adenine phosphoribosyltransferase  46.11 
 
 
175 aa  147  7e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1814  adenine phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
188 aa  147  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.068208  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
172 aa  147  8e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1819  adenine phosphoribosyltransferase  47.56 
 
 
170 aa  147  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0215427  normal  0.463714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
172 aa  147  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  46.82 
 
 
181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
187 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  43.35 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  46.79 
 
 
170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  45.96 
 
 
172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  45.4 
 
 
184 aa  145  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 
173 aa  145  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00395  adenine phosphoribosyltransferase  50.91 
 
 
186 aa  145  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  45.34 
 
 
179 aa  145  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  43.11 
 
 
171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  42.53 
 
 
179 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  43.56 
 
 
174 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  44.03 
 
 
186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  45.98 
 
 
185 aa  144  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
170 aa  144  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  44.25 
 
 
183 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  41.14 
 
 
181 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  46.54 
 
 
183 aa  143  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
182 aa  143  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0435  adenine phosphoribosyltransferase  46.95 
 
 
170 aa  143  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0752595 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 
183 aa  143  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 
183 aa  143  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  48.72 
 
 
187 aa  143  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
185 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  43.68 
 
 
181 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  46.54 
 
 
183 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  46.54 
 
 
183 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  46.54 
 
 
183 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
181 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  40.57 
 
 
181 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  46.54 
 
 
183 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 
184 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 
184 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  45.66 
 
 
181 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  43.11 
 
 
179 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  45.55 
 
 
188 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  46.54 
 
 
183 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  46.54 
 
 
183 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 
184 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 
199 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  46.54 
 
 
183 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 
184 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  46.54 
 
 
183 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 
175 aa  143  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  44.25 
 
 
187 aa  142  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  40.57 
 
 
181 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  43.93 
 
 
185 aa  142  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  46.54 
 
 
183 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
181 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  45.57 
 
 
172 aa  142  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  47.17 
 
 
198 aa  142  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0401  adenine phosphoribosyltransferase  46.75 
 
 
171 aa  142  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  42.7 
 
 
181 aa  142  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  44.25 
 
 
181 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  44.25 
 
 
187 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  44.25 
 
 
187 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  46.99 
 
 
185 aa  141  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  44.25 
 
 
183 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  43.68 
 
 
184 aa  142  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  44.65 
 
 
179 aa  141  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
178 aa  141  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>