More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0732 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
172 aa  343  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  57.99 
 
 
170 aa  203  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  54.07 
 
 
175 aa  195  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  53.8 
 
 
172 aa  192  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  53.8 
 
 
172 aa  192  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  56.55 
 
 
170 aa  192  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  55.62 
 
 
170 aa  191  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  57.74 
 
 
170 aa  190  8e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 
171 aa  181  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 
172 aa  180  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 
172 aa  180  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
174 aa  178  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1473  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
176 aa  176  1e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
172 aa  175  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
170 aa  175  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
170 aa  175  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  50.61 
 
 
173 aa  174  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 
172 aa  174  7e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 
170 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
172 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  53.01 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
172 aa  172  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  52.07 
 
 
168 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
170 aa  171  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
170 aa  171  3.9999999999999995e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  48.52 
 
 
173 aa  169  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
174 aa  168  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2050  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
180 aa  167  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4152  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
170 aa  167  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
173 aa  167  5e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0708  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
170 aa  167  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4527  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
170 aa  167  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  54.27 
 
 
171 aa  167  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  52.07 
 
 
178 aa  167  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
175 aa  167  7e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2288  Adenine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 
171 aa  167  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.25421  hitchhiker  0.000000391935 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
424 aa  167  9e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4492  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
170 aa  166  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
173 aa  166  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4303  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
170 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4141  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
170 aa  166  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4638  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
170 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4488  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
170 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160658 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4542  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
170 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
171 aa  166  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4255  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
170 aa  165  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
182 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1069  adenine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
175 aa  165  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
172 aa  164  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3124  adenine phosphoribosyltransferase  47.31 
 
 
170 aa  164  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0411014  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1342  adenine phosphoribosyltransferase  51.25 
 
 
184 aa  165  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0382674  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
172 aa  164  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1190  adenine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 
172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 
172 aa  163  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
182 aa  163  9e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 
172 aa  163  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  46.75 
 
 
172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
183 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
183 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  50.32 
 
 
183 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
183 aa  162  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
183 aa  162  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 
172 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
183 aa  162  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
183 aa  162  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
183 aa  162  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
172 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
186 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  53.42 
 
 
181 aa  160  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
172 aa  160  9e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
183 aa  160  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  52.74 
 
 
181 aa  159  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
173 aa  159  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 
179 aa  159  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  50.94 
 
 
175 aa  159  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
175 aa  158  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 
179 aa  158  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
197 aa  158  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
181 aa  157  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
180 aa  157  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0497  adenine phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
170 aa  157  8e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.742896  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  47.31 
 
 
181 aa  157  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
172 aa  157  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0827  adenine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
175 aa  157  9e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010482  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
171 aa  156  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
180 aa  156  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
181 aa  156  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  50.97 
 
 
178 aa  156  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
171 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
181 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
187 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  46.99 
 
 
184 aa  155  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0401  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
171 aa  155  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
181 aa  155  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
187 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>