More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17570 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_17570  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
177 aa  334  3.9999999999999995e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0869037 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1364  adenine phosphoribosyltransferase  67.47 
 
 
178 aa  201  6e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.647458  normal  0.747385 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  52.98 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  52.98 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14000  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 
183 aa  170  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
171 aa  168  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  53.01 
 
 
168 aa  168  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 
214 aa  167  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
182 aa  167  9e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  55.75 
 
 
180 aa  167  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  55.15 
 
 
176 aa  166  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1800  adenine phosphoribosyltransferase  55.9 
 
 
192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160052  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  51.88 
 
 
172 aa  162  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
174 aa  162  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  50.91 
 
 
178 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
178 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
170 aa  160  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  46.43 
 
 
171 aa  160  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  58.86 
 
 
185 aa  160  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
172 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
174 aa  159  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
178 aa  158  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
178 aa  158  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
424 aa  159  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  50.94 
 
 
179 aa  158  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
187 aa  158  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
172 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 
172 aa  158  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
172 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
171 aa  157  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  48.75 
 
 
172 aa  157  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
171 aa  156  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  50.93 
 
 
172 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  47.31 
 
 
175 aa  156  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 
176 aa  155  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 
172 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
181 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  48.52 
 
 
171 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  48.52 
 
 
172 aa  154  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  47.9 
 
 
173 aa  154  9e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
171 aa  154  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
170 aa  153  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2318  adenine phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
174 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0173481  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  53.7 
 
 
172 aa  153  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
179 aa  153  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2279  adenine phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
174 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2326  adenine phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
174 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.954374  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
180 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
181 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1672  adenine phosphoribosyltransferase  61.02 
 
 
201 aa  152  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0455  adenine phosphoribosyltransferase  44.25 
 
 
193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00282145  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
181 aa  151  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 
176 aa  151  4e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
181 aa  151  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
181 aa  151  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 
170 aa  151  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
177 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
188 aa  150  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 
172 aa  150  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 
172 aa  150  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
181 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
175 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  44.97 
 
 
171 aa  149  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 
173 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  44.97 
 
 
171 aa  149  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
172 aa  149  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  48.52 
 
 
173 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 
171 aa  149  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1814  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
188 aa  149  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.068208  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 
171 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  51.22 
 
 
174 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  46.11 
 
 
172 aa  149  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3124  adenine phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
170 aa  148  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0411014  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 
177 aa  149  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
170 aa  148  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
177 aa  148  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1998  adenine phosphoribosyltransferase  56.52 
 
 
183 aa  147  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0411491 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  46.06 
 
 
177 aa  147  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
175 aa  147  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  46.06 
 
 
181 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
181 aa  147  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 
181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  48.47 
 
 
193 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  48.1 
 
 
173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13880  adenine phosphoribosyltransferase  55.63 
 
 
173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.635045  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  50.94 
 
 
172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  48.73 
 
 
186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0435  adenine phosphoribosyltransferase  47.2 
 
 
170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0752595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  45.09 
 
 
185 aa  145  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
172 aa  145  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1190  adenine phosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
172 aa  145  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4488  adenine phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
170 aa  144  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160658 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4638  adenine phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
170 aa  144  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2784  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
188 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>