More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1998 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1998  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
183 aa  340  9e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0411491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
172 aa  178  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  57.32 
 
 
172 aa  177  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  56.79 
 
 
176 aa  170  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1800  adenine phosphoribosyltransferase  55.75 
 
 
192 aa  169  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160052  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
173 aa  164  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  54.43 
 
 
175 aa  162  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  54.91 
 
 
185 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  52.69 
 
 
168 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  47.24 
 
 
170 aa  159  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  49.09 
 
 
172 aa  158  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  49.09 
 
 
172 aa  158  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  46.99 
 
 
171 aa  157  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  51.14 
 
 
188 aa  157  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
170 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  56.67 
 
 
184 aa  155  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1364  adenine phosphoribosyltransferase  55.9 
 
 
178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.647458  normal  0.747385 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
173 aa  154  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
179 aa  154  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  48.41 
 
 
178 aa  154  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1509  adenine phosphoribosyltransferase  55.06 
 
 
185 aa  154  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0125965  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
190 aa  154  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  48.43 
 
 
185 aa  154  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  46.95 
 
 
170 aa  153  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
187 aa  153  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
205 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  45.73 
 
 
176 aa  152  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 
171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  47.17 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1672  adenine phosphoribosyltransferase  63.29 
 
 
201 aa  151  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 
181 aa  152  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  45.78 
 
 
171 aa  151  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  51.27 
 
 
172 aa  151  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
172 aa  151  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  49.38 
 
 
181 aa  151  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
194 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  48.73 
 
 
185 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  47.5 
 
 
180 aa  151  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
177 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  48.1 
 
 
179 aa  150  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
181 aa  150  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  48.17 
 
 
184 aa  150  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
171 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
174 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1814  adenine phosphoribosyltransferase  53.42 
 
 
188 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.068208  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
171 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
182 aa  150  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
174 aa  150  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
180 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  40.85 
 
 
174 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
181 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
172 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  50.67 
 
 
181 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
181 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
185 aa  149  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13880  adenine phosphoribosyltransferase  56 
 
 
173 aa  149  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.635045  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  45.73 
 
 
180 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  47.56 
 
 
184 aa  149  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
172 aa  148  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2115  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
175 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00527883  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
179 aa  148  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
181 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  49.33 
 
 
181 aa  148  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  48.17 
 
 
184 aa  149  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
177 aa  148  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  46.84 
 
 
177 aa  148  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  52.8 
 
 
172 aa  148  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  44.1 
 
 
199 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0603  adenine phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
188 aa  148  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0244339 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
172 aa  148  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  42.68 
 
 
178 aa  148  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
172 aa  148  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
172 aa  148  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  45.96 
 
 
170 aa  148  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0272  adenine phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
202 aa  148  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
202 aa  147  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3745  adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
181 aa  147  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
214 aa  147  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
172 aa  147  8e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4115  adenine phosphoribosyltransferase  48.41 
 
 
188 aa  147  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  52.29 
 
 
179 aa  147  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  43.03 
 
 
171 aa  147  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  58.6 
 
 
185 aa  147  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0417  adenine phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
231 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  44.85 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  43.2 
 
 
171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0531  adenine phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 
188 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0784653  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0333  adenine phosphoribosyltransferase  45.98 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0604  adenine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0772  adenine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
187 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  45.78 
 
 
178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17570  adenine phosphoribosyltransferase  56.52 
 
 
177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0869037 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 
179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1342  adenine phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0382674  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  51.95 
 
 
181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2318  adenine phosphoribosyltransferase  52.53 
 
 
174 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0173481  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  46.5 
 
 
181 aa  145  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
184 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  47.56 
 
 
185 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>