More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3745 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3745  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
181 aa  363  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  66.85 
 
 
185 aa  251  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  66.85 
 
 
183 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  66.3 
 
 
181 aa  248  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  66.3 
 
 
183 aa  248  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  66.3 
 
 
183 aa  248  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  65.75 
 
 
184 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  65.75 
 
 
184 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  65.75 
 
 
184 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  65.75 
 
 
184 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  66.3 
 
 
183 aa  248  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  65.75 
 
 
184 aa  247  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  64.97 
 
 
185 aa  246  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  64.41 
 
 
185 aa  246  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  62.64 
 
 
182 aa  243  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  62.98 
 
 
181 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  64.64 
 
 
182 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  62.98 
 
 
197 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  64.09 
 
 
184 aa  241  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  62.43 
 
 
181 aa  241  6e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  64.09 
 
 
181 aa  240  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  60.99 
 
 
182 aa  238  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  62.98 
 
 
181 aa  237  5.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  62.64 
 
 
187 aa  236  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  62.64 
 
 
187 aa  236  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  62.84 
 
 
198 aa  235  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  62.09 
 
 
187 aa  235  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  61.33 
 
 
181 aa  234  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  61.33 
 
 
181 aa  234  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  63.93 
 
 
183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  63.93 
 
 
183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  63.93 
 
 
183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  63.93 
 
 
183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  63.93 
 
 
183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  63.93 
 
 
183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  63.93 
 
 
183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  63.93 
 
 
183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  63.93 
 
 
183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  63.93 
 
 
183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  63.93 
 
 
183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  63.93 
 
 
183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  63.93 
 
 
183 aa  232  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  63.39 
 
 
183 aa  231  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  62.84 
 
 
183 aa  230  8.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  61.99 
 
 
178 aa  228  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1201  adenine phosphoribosyltransferase  59.77 
 
 
174 aa  226  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  60.23 
 
 
178 aa  216  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  57.31 
 
 
181 aa  208  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
175 aa  184  6e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  48.52 
 
 
173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
173 aa  181  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  48.07 
 
 
181 aa  182  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  46.96 
 
 
181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  53.25 
 
 
175 aa  181  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  47.51 
 
 
181 aa  180  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  47.51 
 
 
181 aa  179  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
179 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
179 aa  179  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  47.73 
 
 
180 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  48.07 
 
 
180 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  45.86 
 
 
181 aa  178  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
181 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
178 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
199 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
172 aa  174  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 
179 aa  174  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
178 aa  174  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
177 aa  174  7e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  48.04 
 
 
187 aa  174  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
172 aa  173  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  51.52 
 
 
170 aa  173  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 
186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0680  adenine phosphoribosyltransferase  47.19 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  47.19 
 
 
179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 
179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 
172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  45.09 
 
 
181 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 
178 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 
171 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  43.18 
 
 
202 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  48.07 
 
 
179 aa  168  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0272  adenine phosphoribosyltransferase  43.18 
 
 
202 aa  168  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  45.09 
 
 
181 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 
171 aa  167  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  43.82 
 
 
184 aa  167  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0417  adenine phosphoribosyltransferase  43.79 
 
 
231 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 
171 aa  166  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
174 aa  166  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
178 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  43.93 
 
 
181 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0827  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
175 aa  166  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010482  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 
180 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
194 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>