More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04860 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
177 aa  351  2.9999999999999997e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  69.32 
 
 
177 aa  256  1e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0755  Adenine phosphoribosyltransferase  61.02 
 
 
177 aa  238  4e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  60.42 
 
 
187 aa  190  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  60.42 
 
 
187 aa  190  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  60.42 
 
 
187 aa  189  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
182 aa  187  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  60.42 
 
 
182 aa  186  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  61.11 
 
 
183 aa  184  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  61.11 
 
 
183 aa  184  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  61.11 
 
 
183 aa  184  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  61.11 
 
 
183 aa  184  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  61.11 
 
 
183 aa  184  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  61.11 
 
 
183 aa  184  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  61.11 
 
 
183 aa  184  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  61.11 
 
 
183 aa  184  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 
184 aa  183  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 
184 aa  183  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 
184 aa  183  9e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 
184 aa  183  9e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  60.42 
 
 
183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  55.42 
 
 
198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  60.42 
 
 
183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  54.88 
 
 
184 aa  182  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  59.72 
 
 
197 aa  181  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  57.64 
 
 
181 aa  181  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 
184 aa  181  6e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  53.01 
 
 
183 aa  179  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
182 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  54.22 
 
 
185 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  57.64 
 
 
181 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
170 aa  178  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 
183 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 
181 aa  177  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  53.05 
 
 
182 aa  177  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 
181 aa  177  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  56.94 
 
 
183 aa  177  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  56.94 
 
 
183 aa  177  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 
185 aa  177  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  57.64 
 
 
185 aa  176  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  56.94 
 
 
183 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  57.64 
 
 
183 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  57.64 
 
 
183 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  57.64 
 
 
183 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  57.64 
 
 
183 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3745  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
181 aa  174  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  56.25 
 
 
181 aa  173  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
176 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 
172 aa  173  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 
181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  54.25 
 
 
171 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 
181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 
181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 
184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 
172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
178 aa  171  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 
172 aa  171  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  53.21 
 
 
181 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  55.78 
 
 
181 aa  171  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
170 aa  170  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  53.94 
 
 
181 aa  170  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
171 aa  170  9e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  55.92 
 
 
168 aa  170  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  50.64 
 
 
170 aa  169  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 
170 aa  169  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  51.97 
 
 
180 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  52.9 
 
 
177 aa  169  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 
179 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  51.22 
 
 
181 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  51.97 
 
 
181 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  54.42 
 
 
181 aa  168  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0781  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
172 aa  168  4e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  53.69 
 
 
181 aa  167  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
199 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  53.8 
 
 
172 aa  167  6e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  54.3 
 
 
176 aa  167  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  53.09 
 
 
185 aa  167  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  52.67 
 
 
175 aa  167  9e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  50.64 
 
 
171 aa  166  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  54.19 
 
 
180 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  51.68 
 
 
181 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  52.29 
 
 
424 aa  166  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 
175 aa  165  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  51.01 
 
 
181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  53.02 
 
 
180 aa  165  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  52.23 
 
 
173 aa  164  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1118  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
182 aa  164  8e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00971568  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  51.68 
 
 
179 aa  164  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  54.36 
 
 
177 aa  164  9e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 
175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  51.68 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  50.33 
 
 
174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
214 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>