More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0332 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 172 aa  350  4e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  87.79 
 
 		 172 aa  320  6e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  68.05 
 
 		 173 aa  247  5e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  62.21 
 
 		 172 aa  228  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 		 173 aa  195  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 		 172 aa  191  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 		 172 aa  191  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  54.44 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 		 171 aa  184  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 		 176 aa  184  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 		 172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 		 174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 		 171 aa  182  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 		 171 aa  181  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 		 176 aa  181  6e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 		 171 aa  179  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  51.74 
 
 		 174 aa  180  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 		 172 aa  177  4e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 170 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  53.05 
 
 		 171 aa  176  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 214 aa  175  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 		 170 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 		 173 aa  176  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 		 168 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 		 173 aa  175  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  52.47 
 
 		 184 aa  175  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 171 aa  174  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 		 171 aa  174  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 		 170 aa  174  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 		 172 aa  174  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 		 172 aa  174  5e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 		 171 aa  174  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 		 172 aa  173  8e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3745  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 170 aa  173  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 		 175 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1473  adenine phosphoribosyltransferase  46.02 
 
 		 176 aa  171  3.9999999999999995e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 		 174 aa  171  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  52.07 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  52.53 
 
 		 424 aa  171  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 		 175 aa  170  6.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 185 aa  170  9e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 		 170 aa  169  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 		 182 aa  168  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3124  adenine phosphoribosyltransferase  49.69 
 
 		 170 aa  168  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0411014  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 		 170 aa  168  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 		 181 aa  168  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 172 aa  167  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0827  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 175 aa  167  5e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 		 180 aa  167  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0401  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 171 aa  167  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 		 205 aa  167  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 		 172 aa  166  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  48.45 
 
 		 197 aa  165  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2115  adenine phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 		 175 aa  164  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00527883  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 172 aa  164  5e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  47.37 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  52.9 
 
 		 184 aa  164  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  49.02 
 
 		 182 aa  164  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 		 170 aa  164  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  44.71 
 
 		 173 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 		 177 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 		 170 aa  164  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  55.26 
 
 		 187 aa  164  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 		 172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 		 190 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  47.56 
 
 		 183 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  46.75 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  47.56 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  47.56 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  47.56 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  47.56 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  47.56 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 		 184 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 		 184 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  47.56 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  47.56 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  47.56 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4255  adenine phosphoribosyltransferase  48.45 
 
 		 170 aa  162  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  47.17 
 
 		 182 aa  161  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 		 184 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 		 184 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  52.26 
 
 		 184 aa  162  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1005  adenine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 		 182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.233001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0751  adenine phosphoribosyltransferase  53.05 
 
 		 172 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>