More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0827 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0827  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 175 aa  356  8e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  57.06 
 
 		 172 aa  207  7e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4152  adenine phosphoribosyltransferase  58.24 
 
 		 170 aa  207  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0708  adenine phosphoribosyltransferase  58.24 
 
 		 170 aa  207  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4527  adenine phosphoribosyltransferase  58.24 
 
 		 170 aa  207  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  57.06 
 
 		 172 aa  207  7e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3124  adenine phosphoribosyltransferase  57.06 
 
 		 170 aa  206  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0411014  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 		 172 aa  206  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4255  adenine phosphoribosyltransferase  57.65 
 
 		 170 aa  206  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4492  adenine phosphoribosyltransferase  57.65 
 
 		 170 aa  206  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4303  adenine phosphoribosyltransferase  57.65 
 
 		 170 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4141  adenine phosphoribosyltransferase  57.65 
 
 		 170 aa  206  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4488  adenine phosphoribosyltransferase  57.65 
 
 		 170 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160658 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4542  adenine phosphoribosyltransferase  57.65 
 
 		 170 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4638  adenine phosphoribosyltransferase  57.65 
 
 		 170 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  54.71 
 
 		 170 aa  204  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  54.71 
 
 		 170 aa  203  9e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  55.81 
 
 		 172 aa  201  5e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 		 170 aa  201  6e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1069  adenine phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 		 175 aa  197  5e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 		 174 aa  197  9e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1190  adenine phosphoribosyltransferase  54.07 
 
 		 172 aa  195  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1473  adenine phosphoribosyltransferase  56.79 
 
 		 176 aa  191  5e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 		 172 aa  191  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 		 172 aa  191  6e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 		 170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 		 170 aa  181  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 		 183 aa  180  9.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  53.49 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 		 187 aa  177  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 		 174 aa  177  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 		 187 aa  177  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 		 187 aa  177  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 172 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 		 173 aa  174  6e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 		 180 aa  174  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 172 aa  174  6e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 		 183 aa  173  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 		 183 aa  173  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 		 183 aa  173  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 		 183 aa  173  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  51.74 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 		 197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 		 183 aa  171  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 		 181 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 		 185 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 		 171 aa  168  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 		 181 aa  168  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 184 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 184 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 184 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 184 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 172 aa  167  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 		 173 aa  167  5e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 		 182 aa  167  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 		 184 aa  167  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 		 172 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3745  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 		 178 aa  165  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 		 182 aa  164  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0755  Adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 		 170 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 		 171 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 172 aa  164  6.9999999999999995e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 		 172 aa  163  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  46.39 
 
 		 184 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 		 170 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  44.77 
 
 		 173 aa  160  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 172 aa  160  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 172 aa  160  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 		 214 aa  159  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>