More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2091 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
176 aa  338  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  68.05 
 
 
184 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  64.94 
 
 
168 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2115  adenine phosphoribosyltransferase  60.69 
 
 
175 aa  197  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00527883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  56.36 
 
 
177 aa  190  8e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  59.77 
 
 
172 aa  187  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  53.09 
 
 
182 aa  186  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  54.82 
 
 
172 aa  184  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  54.04 
 
 
214 aa  184  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
172 aa  184  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  54.6 
 
 
172 aa  184  6e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
170 aa  184  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  51.52 
 
 
170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  52.12 
 
 
170 aa  180  8.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
174 aa  180  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  53.25 
 
 
175 aa  179  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
170 aa  179  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  49.7 
 
 
173 aa  179  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
173 aa  177  4.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  52.69 
 
 
172 aa  177  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  52.1 
 
 
182 aa  176  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  55.69 
 
 
179 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  53.8 
 
 
185 aa  176  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1339  adenine phosphoribosyltransferase  57.8 
 
 
177 aa  176  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36012  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  53.46 
 
 
179 aa  174  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  51.53 
 
 
172 aa  175  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
181 aa  174  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 
173 aa  174  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1375  adenine phosphoribosyltransferase  58.72 
 
 
188 aa  174  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.801683  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
174 aa  174  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  55.41 
 
 
173 aa  174  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
170 aa  173  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
180 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  57.06 
 
 
185 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0455  adenine phosphoribosyltransferase  55.48 
 
 
193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00282145  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  56.21 
 
 
181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  51.28 
 
 
181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
171 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  53.42 
 
 
171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  54.04 
 
 
177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2358  adenine phosphoribosyltransferase  58.9 
 
 
187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  56.47 
 
 
187 aa  171  5.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2005  adenine phosphoribosyltransferase  50.63 
 
 
181 aa  171  5.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00122085  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 
171 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  55.83 
 
 
180 aa  170  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  52.1 
 
 
177 aa  170  9e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  58.64 
 
 
185 aa  169  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  47.53 
 
 
171 aa  169  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
172 aa  169  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
187 aa  170  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
187 aa  170  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 
175 aa  169  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
172 aa  169  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 
182 aa  169  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  50.9 
 
 
205 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5140  adenine phosphoribosyltransferase  57.58 
 
 
184 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016274 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
187 aa  169  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  50.92 
 
 
199 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  51.23 
 
 
190 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
175 aa  169  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  49.06 
 
 
170 aa  169  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
172 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  55.49 
 
 
188 aa  169  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  46.06 
 
 
170 aa  169  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  51.53 
 
 
172 aa  168  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  54.9 
 
 
181 aa  168  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1814  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 
188 aa  168  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.068208  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 
174 aa  167  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 
179 aa  167  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  53.42 
 
 
175 aa  167  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  53.25 
 
 
179 aa  167  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0401  adenine phosphoribosyltransferase  50.61 
 
 
171 aa  166  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
197 aa  166  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0781  adenine phosphoribosyltransferase  48.41 
 
 
172 aa  166  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  53.99 
 
 
179 aa  166  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
181 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
185 aa  166  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
183 aa  166  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
171 aa  166  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  49.11 
 
 
185 aa  166  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
170 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  49.09 
 
 
181 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
180 aa  166  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
181 aa  165  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  48.73 
 
 
173 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  53.59 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  51.53 
 
 
172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  51.53 
 
 
172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
170 aa  165  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>