More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1339 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1339  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
177 aa  345  1e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36012  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  65.45 
 
 
168 aa  210  7e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2115  adenine phosphoribosyltransferase  66.47 
 
 
175 aa  209  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00527883  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  59.41 
 
 
184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 
177 aa  199  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  57.8 
 
 
176 aa  192  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  61.49 
 
 
172 aa  191  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  56.1 
 
 
181 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  58.17 
 
 
181 aa  189  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  58.17 
 
 
181 aa  189  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  55.83 
 
 
178 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  58.71 
 
 
181 aa  184  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
181 aa  184  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
177 aa  184  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  57.42 
 
 
181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  53.99 
 
 
171 aa  181  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  51.5 
 
 
170 aa  180  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  53.5 
 
 
181 aa  178  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  53.5 
 
 
180 aa  178  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  55.41 
 
 
172 aa  177  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  53.5 
 
 
181 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  49.38 
 
 
181 aa  177  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  56.13 
 
 
179 aa  177  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  52.69 
 
 
181 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0781  adenine phosphoribosyltransferase  47.9 
 
 
172 aa  177  5.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 
173 aa  177  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  52.07 
 
 
172 aa  177  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  55.35 
 
 
175 aa  177  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  55.23 
 
 
188 aa  176  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  54.94 
 
 
171 aa  176  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0751  adenine phosphoribosyltransferase  59.04 
 
 
172 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
199 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0802  adenine phosphoribosyltransferase  58.43 
 
 
172 aa  175  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 
194 aa  176  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  52.83 
 
 
182 aa  176  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0798  adenine phosphoribosyltransferase  58.43 
 
 
172 aa  175  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0128483  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  53.37 
 
 
172 aa  176  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
214 aa  175  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  53.55 
 
 
175 aa  175  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  55.19 
 
 
179 aa  174  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
174 aa  174  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
184 aa  174  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 
170 aa  174  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
184 aa  174  8e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
172 aa  173  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  52.07 
 
 
171 aa  173  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  52.07 
 
 
171 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
172 aa  173  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  51.5 
 
 
182 aa  173  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  49.08 
 
 
171 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  51.88 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  57.82 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  50.91 
 
 
181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1814  adenine phosphoribosyltransferase  54.34 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.068208  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 
180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  50.6 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 
179 aa  171  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  52.83 
 
 
182 aa  171  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  58.48 
 
 
187 aa  171  5.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
171 aa  170  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1800  adenine phosphoribosyltransferase  54.91 
 
 
192 aa  170  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160052  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 
179 aa  170  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 
183 aa  169  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
184 aa  170  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
187 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
179 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  51.5 
 
 
197 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  52.12 
 
 
174 aa  169  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
187 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
183 aa  169  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
187 aa  168  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  52.83 
 
 
178 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 
185 aa  168  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
173 aa  168  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
181 aa  168  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  52.83 
 
 
178 aa  168  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  46.99 
 
 
190 aa  168  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  52.12 
 
 
171 aa  167  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 
183 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1118  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
182 aa  167  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00971568  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 
183 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 
183 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 
183 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  50.94 
 
 
179 aa  167  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2358  adenine phosphoribosyltransferase  58.02 
 
 
187 aa  167  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 
185 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 
178 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  56.69 
 
 
185 aa  166  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 
198 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  51.5 
 
 
177 aa  166  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
196 aa  165  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  53.9 
 
 
187 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>