More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3049 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
185 aa  348  3e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  61.18 
 
 
168 aa  174  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 
172 aa  171  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  58.64 
 
 
176 aa  169  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  54.8 
 
 
184 aa  170  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5140  adenine phosphoribosyltransferase  59.77 
 
 
184 aa  168  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  60.12 
 
 
172 aa  158  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1375  adenine phosphoribosyltransferase  57.8 
 
 
188 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.801683  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
172 aa  156  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
177 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  51.25 
 
 
214 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2358  adenine phosphoribosyltransferase  56.02 
 
 
187 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1800  adenine phosphoribosyltransferase  57.71 
 
 
192 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160052  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1944  Adenine phosphoribosyltransferase  59.01 
 
 
186 aa  154  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00976399  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  44.24 
 
 
172 aa  154  6e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  50.93 
 
 
174 aa  154  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
172 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2115  adenine phosphoribosyltransferase  55.83 
 
 
175 aa  153  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00527883  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  54.6 
 
 
188 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1814  adenine phosphoribosyltransferase  54.02 
 
 
188 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.068208  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  48.75 
 
 
173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 
180 aa  151  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00395  adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 
186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 
171 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  46.25 
 
 
176 aa  150  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  49.34 
 
 
175 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1364  adenine phosphoribosyltransferase  55 
 
 
178 aa  150  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.647458  normal  0.747385 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15120  adenine phosphoribosyltransferase  54.04 
 
 
175 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1339  adenine phosphoribosyltransferase  56.69 
 
 
177 aa  149  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36012  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
173 aa  149  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
170 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  45.06 
 
 
172 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  45.06 
 
 
172 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2279  adenine phosphoribosyltransferase  51.7 
 
 
174 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2318  adenine phosphoribosyltransferase  51.7 
 
 
174 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0173481  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2326  adenine phosphoribosyltransferase  51.7 
 
 
174 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.954374  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2586  adenine phosphoribosyltransferase  54.27 
 
 
174 aa  147  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  47.53 
 
 
171 aa  147  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
185 aa  147  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
170 aa  147  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  46.84 
 
 
170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  47.5 
 
 
172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17570  adenine phosphoribosyltransferase  58.86 
 
 
177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0869037 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  47.5 
 
 
170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  49.03 
 
 
179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  44.72 
 
 
171 aa  146  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1998  adenine phosphoribosyltransferase  54.91 
 
 
183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0411491 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
185 aa  145  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
179 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  48.68 
 
 
170 aa  144  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  50.66 
 
 
171 aa  144  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
187 aa  144  5e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  49.38 
 
 
179 aa  145  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  48.68 
 
 
178 aa  144  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  44.03 
 
 
172 aa  144  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  44.03 
 
 
172 aa  144  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
182 aa  144  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  46.91 
 
 
174 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
181 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  56.36 
 
 
185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
172 aa  144  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  45.06 
 
 
172 aa  144  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 
170 aa  143  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 
181 aa  143  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3813  adenine phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 
179 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0904052  normal  0.50341 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  48.03 
 
 
178 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 
199 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 
172 aa  142  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  51.08 
 
 
177 aa  142  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  42.59 
 
 
175 aa  142  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13880  adenine phosphoribosyltransferase  55.97 
 
 
173 aa  142  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.635045  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  41.72 
 
 
172 aa  142  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  47.53 
 
 
187 aa  142  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  45.75 
 
 
171 aa  141  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
193 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  43.83 
 
 
172 aa  141  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14000  adenine phosphoribosyltransferase  46.99 
 
 
183 aa  141  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  46.1 
 
 
181 aa  141  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  46.1 
 
 
181 aa  141  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2005  adenine phosphoribosyltransferase  41.1 
 
 
181 aa  141  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00122085  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 
181 aa  141  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  43.31 
 
 
182 aa  141  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  44.87 
 
 
170 aa  141  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
178 aa  140  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12604  adenine phosphoribosyltransferase  56.47 
 
 
223 aa  140  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.793855  normal  0.485658 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  41.25 
 
 
170 aa  140  8e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 
181 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  42.24 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  44.59 
 
 
181 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
179 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1672  adenine phosphoribosyltransferase  60.13 
 
 
201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  46.84 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  42.58 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  43.79 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  45.75 
 
 
198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>