More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2391 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
185 aa  355  2.9999999999999997e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  61.18 
 
 
184 aa  192  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  57.06 
 
 
176 aa  184  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1814  adenine phosphoribosyltransferase  57.99 
 
 
188 aa  181  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.068208  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  57.4 
 
 
188 aa  179  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  59.06 
 
 
172 aa  175  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
168 aa  175  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  54.82 
 
 
214 aa  174  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 
172 aa  174  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  55.09 
 
 
172 aa  173  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  52.76 
 
 
172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 
174 aa  171  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
172 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
172 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 
172 aa  169  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2115  adenine phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
175 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00527883  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  57.06 
 
 
171 aa  169  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
172 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0781  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
172 aa  167  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  51.79 
 
 
174 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  56.55 
 
 
187 aa  166  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  55.62 
 
 
177 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
170 aa  166  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2358  adenine phosphoribosyltransferase  54.97 
 
 
187 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 
173 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  52.41 
 
 
170 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  53.37 
 
 
170 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  50.3 
 
 
173 aa  162  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
172 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  48.31 
 
 
181 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  52.87 
 
 
185 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  50.62 
 
 
177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  52.07 
 
 
177 aa  160  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  54.71 
 
 
180 aa  160  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  53.25 
 
 
170 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  52.76 
 
 
185 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  48 
 
 
197 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3124  adenine phosphoribosyltransferase  52.23 
 
 
170 aa  159  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0411014  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
170 aa  158  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
170 aa  159  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1339  adenine phosphoribosyltransferase  58.48 
 
 
177 aa  158  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36012  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
176 aa  158  4e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
179 aa  158  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4527  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
170 aa  157  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4152  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
170 aa  157  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
171 aa  157  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0708  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
170 aa  157  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  51.25 
 
 
182 aa  157  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  48.77 
 
 
184 aa  157  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4492  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
170 aa  157  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4303  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
170 aa  157  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4141  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
170 aa  157  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4542  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
170 aa  157  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4638  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
170 aa  157  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4488  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
170 aa  157  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160658 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  51.27 
 
 
178 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 
182 aa  156  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 
171 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  51.28 
 
 
424 aa  156  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  51.27 
 
 
181 aa  155  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 
181 aa  156  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
187 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
187 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
187 aa  155  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4255  adenine phosphoribosyltransferase  52.83 
 
 
170 aa  155  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1473  adenine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 
176 aa  155  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  56.36 
 
 
185 aa  155  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  52.87 
 
 
185 aa  155  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
181 aa  155  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 
170 aa  154  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
170 aa  154  6e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  52.5 
 
 
198 aa  154  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
184 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
184 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
184 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
184 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3745  adenine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
181 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  47.31 
 
 
172 aa  154  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
171 aa  153  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
181 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
183 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14000  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
183 aa  153  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  47.9 
 
 
176 aa  152  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  48.43 
 
 
171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3172  phosphoribosyltransferase  53.93 
 
 
197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186251  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1190  adenine phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5140  adenine phosphoribosyltransferase  53.04 
 
 
184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0751  adenine phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
172 aa  151  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48734  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1375  adenine phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 
188 aa  151  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.801683  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0798  adenine phosphoribosyltransferase  54.44 
 
 
172 aa  151  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0128483  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0802  adenine phosphoribosyltransferase  54.44 
 
 
172 aa  151  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
172 aa  151  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  48.1 
 
 
183 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  48.1 
 
 
183 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
182 aa  151  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 
170 aa  150  7e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 
172 aa  151  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>