More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2358 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2358  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 187 aa  362  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  60.34 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  58.9 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  61.39 
 
 		 168 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2115  adenine phosphoribosyltransferase  62.2 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00527883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  62.96 
 
 		 172 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5140  adenine phosphoribosyltransferase  59.41 
 
 		 184 aa  174  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016274 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0781  adenine phosphoribosyltransferase  48.45 
 
 		 172 aa  174  8e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  55.68 
 
 		 187 aa  171  6.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  56.02 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  54.97 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  54.22 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1375  adenine phosphoribosyltransferase  57.31 
 
 		 188 aa  167  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.801683  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1814  adenine phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 		 188 aa  167  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.068208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0755  Adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  50.63 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1339  adenine phosphoribosyltransferase  55.37 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36012  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  55.19 
 
 		 170 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  50.56 
 
 		 187 aa  164  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  47.2 
 
 		 182 aa  162  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  49.07 
 
 		 183 aa  161  6e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  49.07 
 
 		 183 aa  161  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  49.07 
 
 		 183 aa  161  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  49.07 
 
 		 183 aa  161  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  49.07 
 
 		 183 aa  161  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  49.07 
 
 		 183 aa  161  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  49.07 
 
 		 183 aa  161  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  49.07 
 
 		 183 aa  161  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  48.47 
 
 		 172 aa  160  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  47.2 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  47.2 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  47.2 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 		 172 aa  159  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  49.69 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  45.78 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2005  adenine phosphoribosyltransferase  45.78 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00122085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  48.45 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 		 171 aa  158  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  48.45 
 
 		 183 aa  158  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  48.45 
 
 		 183 aa  157  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 		 185 aa  157  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  48.45 
 
 		 183 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  48.45 
 
 		 183 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  48.45 
 
 		 183 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  48.45 
 
 		 183 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  45.91 
 
 		 182 aa  155  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 		 171 aa  156  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 		 172 aa  155  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  46.79 
 
 		 424 aa  155  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 		 175 aa  155  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 		 180 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  47.24 
 
 		 172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 		 170 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  45.28 
 
 		 170 aa  154  7e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  50.64 
 
 		 177 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 		 179 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  45.62 
 
 		 197 aa  153  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  48.43 
 
 		 172 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0588  adenine phosphoribosyltransferase  50.63 
 
 		 216 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 		 175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0604  adenine phosphoribosyltransferase  50.63 
 
 		 197 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0772  adenine phosphoribosyltransferase  50.63 
 
 		 187 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1118  adenine phosphoribosyltransferase  43.83 
 
 		 182 aa  152  4e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00971568  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  47.88 
 
 		 174 aa  151  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 		 202 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0798  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 		 172 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0128483  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0802  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 		 172 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  45.4 
 
 		 181 aa  150  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0417  adenine phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 		 231 aa  150  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0272  adenine phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 		 202 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 171 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0751  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 		 172 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48734  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  44.37 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3745  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  46.79 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  48.41 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  50.33 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  44.79 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  42.17 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  48.2 
 
 		 181 aa  149  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  42.69 
 
 		 172 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  42.69 
 
 		 172 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  48.41 
 
 		 181 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  45.22 
 
 		 182 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  48.41 
 
 		 181 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  43.67 
 
 		 183 aa  148  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0493  adenine phosphoribosyltransferase  49.68 
 
 		 188 aa  148  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  44.1 
 
 		 173 aa  148  5e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  45.86 
 
 		 171 aa  148  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 		 181 aa  148  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 		 170 aa  148  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  49.33 
 
 		 170 aa  147  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  50.33 
 
 		 175 aa  148  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>