More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1814 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1814  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
188 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.068208  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  93.09 
 
 
188 aa  322  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  57.99 
 
 
185 aa  181  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3172  phosphoribosyltransferase  56.83 
 
 
197 aa  180  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186251  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  61.21 
 
 
187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2115  adenine phosphoribosyltransferase  55.49 
 
 
175 aa  177  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00527883  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 
176 aa  174  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 
184 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  54.44 
 
 
177 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  55.33 
 
 
170 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  54.91 
 
 
172 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
173 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 
214 aa  166  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  53.37 
 
 
170 aa  166  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  52.17 
 
 
172 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  52.69 
 
 
168 aa  166  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15120  adenine phosphoribosyltransferase  54.27 
 
 
175 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 
170 aa  165  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 
172 aa  164  5e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  52.47 
 
 
171 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2358  adenine phosphoribosyltransferase  53.94 
 
 
187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1339  adenine phosphoribosyltransferase  54.34 
 
 
177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36012  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3124  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0411014  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
182 aa  162  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 
185 aa  161  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4255  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
170 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 
175 aa  160  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4152  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
170 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0708  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
170 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  51.52 
 
 
180 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4527  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
170 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4542  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
170 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4492  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
170 aa  159  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4303  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
170 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4141  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
170 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
171 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4638  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
170 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4488  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
170 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160658 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  48.77 
 
 
182 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
174 aa  159  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
170 aa  159  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  48.19 
 
 
185 aa  158  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
174 aa  158  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
172 aa  157  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0781  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
172 aa  157  7e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
172 aa  157  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  47.62 
 
 
172 aa  157  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1800  adenine phosphoribosyltransferase  54.34 
 
 
192 aa  157  8e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160052  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  54.02 
 
 
185 aa  157  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  47.53 
 
 
170 aa  157  9e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
170 aa  157  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0755  Adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
177 aa  156  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  46.58 
 
 
171 aa  156  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  46.43 
 
 
172 aa  156  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  46.3 
 
 
171 aa  155  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1069  adenine phosphoribosyltransferase  49.66 
 
 
175 aa  155  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
172 aa  155  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14000  adenine phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
183 aa  155  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  48.73 
 
 
170 aa  155  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1473  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
176 aa  155  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0545  adenine phosphoribosyltransferase  43.86 
 
 
173 aa  155  4e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.342183  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
181 aa  155  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  44.62 
 
 
182 aa  155  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  47.47 
 
 
175 aa  154  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
173 aa  154  7e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
170 aa  154  7e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0751  adenine phosphoribosyltransferase  55.95 
 
 
172 aa  154  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48734  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
183 aa  154  8e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
183 aa  154  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  50.61 
 
 
171 aa  154  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 
173 aa  154  9e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  49.17 
 
 
187 aa  154  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1190  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
172 aa  154  9e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  47.2 
 
 
171 aa  153  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  47.1 
 
 
172 aa  153  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0798  adenine phosphoribosyltransferase  55.09 
 
 
172 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0128483  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  47.53 
 
 
178 aa  153  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0802  adenine phosphoribosyltransferase  55.09 
 
 
172 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
183 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  44.31 
 
 
171 aa  152  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
177 aa  153  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  46.01 
 
 
184 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 
175 aa  152  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  46.54 
 
 
176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 
178 aa  151  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
193 aa  151  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  44.72 
 
 
170 aa  151  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  47.53 
 
 
181 aa  151  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  45.96 
 
 
179 aa  151  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  44.79 
 
 
172 aa  151  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  48.67 
 
 
424 aa  150  7e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  46.01 
 
 
184 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  46.01 
 
 
184 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  46.01 
 
 
184 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  46.01 
 
 
184 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3745  adenine phosphoribosyltransferase  46.06 
 
 
181 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>