More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0755 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0755  Adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 177 aa  357  4e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  61.02 
 
 		 177 aa  238  4e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  62.15 
 
 		 177 aa  237  8e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  46.91 
 
 		 175 aa  174  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 		 182 aa  174  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  55.1 
 
 		 183 aa  174  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  55.1 
 
 		 183 aa  174  7e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  55.1 
 
 		 183 aa  174  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  55.1 
 
 		 183 aa  174  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  55.1 
 
 		 183 aa  174  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  55.1 
 
 		 183 aa  174  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  55.1 
 
 		 183 aa  174  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  55.1 
 
 		 183 aa  174  7e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 		 184 aa  174  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  54.42 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  52.78 
 
 		 187 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  52.78 
 
 		 187 aa  171  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  52.78 
 
 		 187 aa  171  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 		 170 aa  171  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  51.48 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  53.74 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  53.06 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  53.74 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  53.74 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  53.74 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  53.06 
 
 		 181 aa  168  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 		 183 aa  168  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 		 197 aa  167  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  53.74 
 
 		 183 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  47.9 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  51.02 
 
 		 182 aa  165  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  48 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  52.08 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  51.02 
 
 		 185 aa  164  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  48.1 
 
 		 170 aa  165  4e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  51.28 
 
 		 181 aa  164  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 		 176 aa  164  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  52.38 
 
 		 181 aa  164  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 170 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0827  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 		 175 aa  164  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  48.52 
 
 		 176 aa  164  6.9999999999999995e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  51.7 
 
 		 184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  51.02 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  51.7 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  46.91 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  49.66 
 
 		 184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 		 424 aa  162  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  49.66 
 
 		 184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  49.66 
 
 		 184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  49.66 
 
 		 184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3745  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 		 181 aa  161  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 		 214 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  46.91 
 
 		 172 aa  161  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  49.66 
 
 		 181 aa  160  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4255  adenine phosphoribosyltransferase  50.63 
 
 		 170 aa  160  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 		 171 aa  160  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 		 168 aa  160  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  50.34 
 
 		 182 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  44 
 
 		 173 aa  160  8.000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 		 172 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3124  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 170 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0411014  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 		 172 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  51.68 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  48.98 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  48.98 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4527  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  48.98 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4492  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4303  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4141  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4152  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4638  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4542  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0708  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  48.98 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4488  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160658 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 		 170 aa  159  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  49.66 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  50.34 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 		 178 aa  157  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2115  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 175 aa  157  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00527883  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  49.01 
 
 		 177 aa  157  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  48.19 
 
 		 172 aa  156  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  46.79 
 
 		 170 aa  156  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  45.09 
 
 		 174 aa  155  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  49.36 
 
 		 170 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  47.5 
 
 		 170 aa  156  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  46.84 
 
 		 172 aa  156  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 		 181 aa  155  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  45.91 
 
 		 181 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  45.91 
 
 		 180 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 		 172 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 		 172 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>