More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3172 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3172  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 197 aa  375  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186251  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  57.92 
 
 		 188 aa  192  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1814  adenine phosphoribosyltransferase  56.83 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.068208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1509  adenine phosphoribosyltransferase  54.26 
 
 		 185 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0125965  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 184 aa  165  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  46.11 
 
 		 187 aa  164  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  46.11 
 
 		 187 aa  164  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  49.17 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  47.7 
 
 		 170 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 176 aa  162  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  45.81 
 
 		 172 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  51.81 
 
 		 168 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  47.03 
 
 		 171 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  45.08 
 
 		 187 aa  161  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  46.49 
 
 		 171 aa  160  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 		 170 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  43.78 
 
 		 176 aa  159  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  45.25 
 
 		 172 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 		 179 aa  158  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  46.55 
 
 		 178 aa  158  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 182 aa  158  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  46.96 
 
 		 173 aa  158  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  53.93 
 
 		 185 aa  158  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 		 174 aa  157  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 		 170 aa  157  7e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  45.14 
 
 		 171 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  43.68 
 
 		 170 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  49.39 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  44.81 
 
 		 172 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 		 170 aa  155  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  51.22 
 
 		 175 aa  155  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  45.81 
 
 		 173 aa  155  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  46.82 
 
 		 170 aa  155  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 		 181 aa  155  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  43.78 
 
 		 172 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 		 185 aa  154  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  49.73 
 
 		 172 aa  154  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15120  adenine phosphoribosyltransferase  52.84 
 
 		 175 aa  154  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  42.7 
 
 		 171 aa  154  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  47.56 
 
 		 179 aa  154  9e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 		 179 aa  154  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  47.75 
 
 		 183 aa  154  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 		 181 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  43.68 
 
 		 170 aa  153  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  43.35 
 
 		 172 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 182 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  43.35 
 
 		 172 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  52.3 
 
 		 187 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  47.56 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  47.75 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  47.75 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  47.75 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  47.75 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  44.69 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  47.75 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  47.75 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  47.75 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1190  adenine phosphoribosyltransferase  43.24 
 
 		 172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  47.75 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  49.73 
 
 		 171 aa  152  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 		 180 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  47.56 
 
 		 181 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  47.75 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  49.14 
 
 		 178 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  46.07 
 
 		 183 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  41.11 
 
 		 174 aa  151  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  44.81 
 
 		 176 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13880  adenine phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.635045  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  49.14 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  43.09 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 		 172 aa  149  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  42.2 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  45.73 
 
 		 181 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  40.66 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4255  adenine phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0827  adenine phosphoribosyltransferase  44.26 
 
 		 175 aa  150  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2318  adenine phosphoribosyltransferase  45.7 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0173481  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  43.68 
 
 		 181 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2115  adenine phosphoribosyltransferase  50.82 
 
 		 175 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00527883  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 		 179 aa  149  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2279  adenine phosphoribosyltransferase  45.7 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  44.77 
 
 		 172 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3124  adenine phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 		 170 aa  149  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0411014  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2326  adenine phosphoribosyltransferase  45.7 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.954374  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  45.09 
 
 		 183 aa  148  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 		 181 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 		 181 aa  148  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>