More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5140 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5140  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 184 aa  356  9e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1375  adenine phosphoribosyltransferase  71.81 
 
 		 188 aa  231  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.801683  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  58.79 
 
 		 168 aa  187  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  57.58 
 
 		 176 aa  184  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  58.01 
 
 		 185 aa  184  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  57.23 
 
 		 184 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2358  adenine phosphoribosyltransferase  59.41 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2115  adenine phosphoribosyltransferase  60.61 
 
 		 175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00527883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  54.91 
 
 		 172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 		 172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 		 170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  54.97 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  50.92 
 
 		 172 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  53.5 
 
 		 171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  51.22 
 
 		 170 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  53.46 
 
 		 172 aa  161  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  48.19 
 
 		 173 aa  161  6e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  45.18 
 
 		 175 aa  160  9e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1339  adenine phosphoribosyltransferase  55.03 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36012  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  52.43 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 		 172 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  49.36 
 
 		 424 aa  159  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  48.19 
 
 		 170 aa  159  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  49.69 
 
 		 175 aa  158  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 		 173 aa  158  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  50.61 
 
 		 173 aa  158  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  44.31 
 
 		 170 aa  157  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  45.18 
 
 		 182 aa  157  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 171 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 		 187 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  49.39 
 
 		 178 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  44.91 
 
 		 173 aa  156  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  54.19 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2005  adenine phosphoribosyltransferase  44.65 
 
 		 181 aa  155  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00122085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 		 182 aa  155  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0781  adenine phosphoribosyltransferase  44.31 
 
 		 172 aa  154  6e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2050  adenine phosphoribosyltransferase  49.39 
 
 		 180 aa  154  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0401  adenine phosphoribosyltransferase  51.28 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  53.04 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 		 172 aa  153  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 		 172 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 181 aa  153  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 181 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  46.95 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1800  adenine phosphoribosyltransferase  59.33 
 
 		 192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160052  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  49.09 
 
 		 174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1118  adenine phosphoribosyltransferase  47.22 
 
 		 182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00971568  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 		 170 aa  152  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  53.8 
 
 		 181 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  45.62 
 
 		 178 aa  151  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 		 180 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  49.02 
 
 		 178 aa  151  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  49.38 
 
 		 181 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  46.75 
 
 		 170 aa  151  5.9999999999999996e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0827  adenine phosphoribosyltransferase  45.12 
 
 		 175 aa  150  7e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  51.32 
 
 		 171 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  48.1 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  53.16 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  50.66 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  47.9 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  44.58 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  44.58 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 		 175 aa  149  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  45.57 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  51.52 
 
 		 179 aa  149  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0755  Adenine phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 		 177 aa  149  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00395  adenine phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 		 186 aa  149  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  46.34 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  48.73 
 
 		 175 aa  149  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 		 178 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0798  adenine phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 		 172 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0128483  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  50.91 
 
 		 179 aa  148  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0802  adenine phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 		 172 aa  148  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3653  adenine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 		 174 aa  148  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 		 178 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14000  adenine phosphoribosyltransferase  45 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  45.12 
 
 		 183 aa  147  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  47.53 
 
 		 179 aa  147  7e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  45.73 
 
 		 183 aa  147  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 174 aa  147  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  51.66 
 
 		 187 aa  147  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  47.17 
 
 		 185 aa  147  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 		 181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  44.69 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 		 172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0751  adenine phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>