More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2050 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2050  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
180 aa  362  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0401  adenine phosphoribosyltransferase  71.18 
 
 
171 aa  250  9.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  64.71 
 
 
171 aa  231  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  54.12 
 
 
170 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  53.45 
 
 
174 aa  177  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
193 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  52.53 
 
 
424 aa  171  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 
170 aa  170  7.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  48.6 
 
 
179 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3653  adenine phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
174 aa  167  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  48.52 
 
 
171 aa  167  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
172 aa  167  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
172 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  48.19 
 
 
178 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
183 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 
170 aa  166  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
170 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  48.19 
 
 
181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
183 aa  165  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
183 aa  165  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  48.5 
 
 
183 aa  165  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
183 aa  165  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
183 aa  165  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
183 aa  165  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
183 aa  165  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
183 aa  165  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
181 aa  164  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
187 aa  164  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
172 aa  164  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
181 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  44.19 
 
 
172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  44.19 
 
 
172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
182 aa  164  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1952  adenine phosphoribosyltransferase  49.06 
 
 
175 aa  163  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000331539  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 
197 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 
172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 
173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
171 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  48.73 
 
 
182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  48.73 
 
 
171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  48.3 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  48.75 
 
 
170 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
181 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  48.73 
 
 
171 aa  162  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 
181 aa  161  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 
172 aa  160  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  47.73 
 
 
176 aa  160  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 
172 aa  160  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 
181 aa  160  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
181 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
181 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
170 aa  160  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  45.09 
 
 
174 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1069  adenine phosphoribosyltransferase  43.93 
 
 
175 aa  160  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
170 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
181 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 
172 aa  159  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
171 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  44.63 
 
 
180 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
171 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0435  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
170 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0752595 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  45.66 
 
 
175 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 
179 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
171 aa  158  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  48.1 
 
 
181 aa  158  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  48.86 
 
 
180 aa  158  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 
172 aa  158  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
184 aa  158  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  46.29 
 
 
179 aa  157  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
183 aa  157  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  43.58 
 
 
181 aa  157  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1819  adenine phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 
170 aa  157  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0215427  normal  0.463714 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1342  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
184 aa  157  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0382674  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
178 aa  157  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  44.57 
 
 
181 aa  157  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
184 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
184 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
184 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
184 aa  157  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
184 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
172 aa  156  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  46.25 
 
 
170 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 
181 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  46.71 
 
 
181 aa  156  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  45.91 
 
 
170 aa  156  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  47.47 
 
 
183 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  47.47 
 
 
183 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  47.47 
 
 
183 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 
172 aa  155  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  47.47 
 
 
183 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 
172 aa  155  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
184 aa  155  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1834  adenine phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 
172 aa  155  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  45.14 
 
 
181 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  46.5 
 
 
185 aa  155  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 
185 aa  154  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>