More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1375 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1375  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 188 aa  360  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.801683  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5140  adenine phosphoribosyltransferase  71.81 
 
 		 184 aa  240  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016274 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  58.72 
 
 		 176 aa  192  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  61.82 
 
 		 168 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  58.82 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2115  adenine phosphoribosyltransferase  60.12 
 
 		 175 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00527883  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  57.8 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2358  adenine phosphoribosyltransferase  57.31 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  56.4 
 
 		 172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  47.31 
 
 		 175 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 		 170 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  46.55 
 
 		 182 aa  164  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 182 aa  164  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1339  adenine phosphoribosyltransferase  56.98 
 
 		 177 aa  164  8e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36012  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  51.22 
 
 		 173 aa  164  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  56.49 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  47.31 
 
 		 172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  48.5 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2318  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 		 174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0173481  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2279  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 		 174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2326  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 		 174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.954374  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  51.23 
 
 		 172 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 		 184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  50.6 
 
 		 170 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 		 172 aa  162  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 		 180 aa  162  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  49.41 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  45.18 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  50.31 
 
 		 170 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  51.23 
 
 		 172 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  48.43 
 
 		 181 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 		 184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  49.1 
 
 		 185 aa  161  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3813  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 		 179 aa  160  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0904052  normal  0.50341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0401  adenine phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 		 171 aa  160  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  51.46 
 
 		 178 aa  160  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  54.19 
 
 		 187 aa  160  9e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 		 177 aa  160  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 170 aa  160  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2005  adenine phosphoribosyltransferase  43.2 
 
 		 181 aa  160  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00122085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  51.23 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3653  adenine phosphoribosyltransferase  50.9 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 		 178 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  49.47 
 
 		 188 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  53.5 
 
 		 172 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 		 177 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2586  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 		 174 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  47.56 
 
 		 170 aa  156  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 		 171 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1814  adenine phosphoribosyltransferase  48.4 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.068208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 		 171 aa  156  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 		 171 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  51.83 
 
 		 184 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 179 aa  156  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0781  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 		 172 aa  156  2e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  46.43 
 
 		 171 aa  155  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  46.43 
 
 		 171 aa  155  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  46.75 
 
 		 197 aa  155  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 		 194 aa  155  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  48.17 
 
 		 198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 		 171 aa  154  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  48.77 
 
 		 175 aa  154  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2050  adenine phosphoribosyltransferase  52.23 
 
 		 180 aa  154  7e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  43.11 
 
 		 171 aa  154  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 		 181 aa  154  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 		 175 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1118  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 		 182 aa  153  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00971568  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 		 172 aa  154  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  47.59 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 		 172 aa  152  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  48.72 
 
 		 424 aa  153  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  48.75 
 
 		 178 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1800  adenine phosphoribosyltransferase  52.49 
 
 		 192 aa  153  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160052  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0827  adenine phosphoribosyltransferase  44.91 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  46.39 
 
 		 182 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  44.77 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  44.05 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  48.43 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 		 190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  46.99 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  46.43 
 
 		 172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  46.3 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 		 171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  46.58 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 		 171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>