More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1944 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1944  Adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
186 aa  347  6e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00976399  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2318  adenine phosphoribosyltransferase  60.98 
 
 
174 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0173481  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2279  adenine phosphoribosyltransferase  60.98 
 
 
174 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2326  adenine phosphoribosyltransferase  60.98 
 
 
174 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.954374  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3813  adenine phosphoribosyltransferase  59.41 
 
 
179 aa  179  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0904052  normal  0.50341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2586  adenine phosphoribosyltransferase  59.41 
 
 
174 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2307  Adenine phosphoribosyltransferase  60.22 
 
 
191 aa  174  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0679858  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12604  adenine phosphoribosyltransferase  60.84 
 
 
223 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.793855  normal  0.485658 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  57.23 
 
 
185 aa  157  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 
176 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15120  adenine phosphoribosyltransferase  53.75 
 
 
175 aa  147  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  48.77 
 
 
168 aa  143  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 
187 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  49.09 
 
 
184 aa  138  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1800  adenine phosphoribosyltransferase  54.17 
 
 
192 aa  138  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160052  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0834  putative adenine phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 
193 aa  135  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
172 aa  136  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  44.77 
 
 
185 aa  136  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  43.93 
 
 
197 aa  135  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 
181 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
181 aa  134  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  45 
 
 
194 aa  134  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  47.2 
 
 
172 aa  134  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  40.46 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 
173 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  40.59 
 
 
181 aa  132  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1998  adenine phosphoribosyltransferase  51.81 
 
 
183 aa  132  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0411491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1814  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 
188 aa  132  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.068208  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 
185 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 
172 aa  132  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  45.91 
 
 
170 aa  131  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  38.73 
 
 
181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  39.76 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  40.61 
 
 
175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0455  adenine phosphoribosyltransferase  44.72 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00282145  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  38.6 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1118  adenine phosphoribosyltransferase  37.36 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00971568  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 
175 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  38.6 
 
 
181 aa  129  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  44.24 
 
 
179 aa  128  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  43.29 
 
 
173 aa  128  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 
182 aa  127  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  40.83 
 
 
172 aa  127  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1509  adenine phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
185 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0125965  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  41.82 
 
 
171 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 
181 aa  127  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1990  adenine phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  44.65 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4115  adenine phosphoribosyltransferase  40.83 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  39.05 
 
 
179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  39.62 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  44.65 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  40.35 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  43.21 
 
 
175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  44.38 
 
 
183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  41.82 
 
 
179 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  40.59 
 
 
180 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  40.88 
 
 
176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  41.82 
 
 
179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  40 
 
 
181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  38.15 
 
 
181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2005  adenine phosphoribosyltransferase  35.98 
 
 
181 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00122085  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  45 
 
 
198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  39.77 
 
 
183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13880  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.635045  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  39.77 
 
 
183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  42.68 
 
 
170 aa  125  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  35.54 
 
 
170 aa  125  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  39.87 
 
 
178 aa  125  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1364  adenine phosphoribosyltransferase  43.1 
 
 
178 aa  124  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.647458  normal  0.747385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  45.34 
 
 
184 aa  124  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  41.21 
 
 
179 aa  124  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
190 aa  124  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  39.77 
 
 
184 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  39.77 
 
 
184 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
187 aa  124  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  39.31 
 
 
181 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
187 aa  124  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 
183 aa  124  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5140  adenine phosphoribosyltransferase  46.93 
 
 
184 aa  124  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016274 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  39.77 
 
 
184 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1339  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
177 aa  124  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36012  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  39.77 
 
 
184 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  39.02 
 
 
172 aa  123  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3172  phosphoribosyltransferase  51.4 
 
 
197 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186251  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
177 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1473  adenine phosphoribosyltransferase  43.04 
 
 
176 aa  124  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  44.31 
 
 
187 aa  123  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>