More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2307 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2307  Adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
191 aa  359  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0679858  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2586  adenine phosphoribosyltransferase  65.56 
 
 
174 aa  191  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3813  adenine phosphoribosyltransferase  64.9 
 
 
179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0904052  normal  0.50341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2318  adenine phosphoribosyltransferase  65.54 
 
 
174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0173481  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2279  adenine phosphoribosyltransferase  65.54 
 
 
174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1944  Adenine phosphoribosyltransferase  60.92 
 
 
186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00976399  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2326  adenine phosphoribosyltransferase  65.54 
 
 
174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.954374  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12604  adenine phosphoribosyltransferase  57.58 
 
 
223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.793855  normal  0.485658 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0455  adenine phosphoribosyltransferase  52.98 
 
 
193 aa  149  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00282145  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
172 aa  149  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  51.95 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  49.69 
 
 
176 aa  145  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
172 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  54 
 
 
214 aa  144  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
184 aa  144  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  53.05 
 
 
185 aa  143  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
171 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  47.16 
 
 
179 aa  142  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  51.33 
 
 
175 aa  142  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  50.63 
 
 
179 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  48.75 
 
 
181 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  45.28 
 
 
181 aa  141  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
181 aa  141  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
181 aa  141  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13880  adenine phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 
173 aa  141  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.635045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 
172 aa  140  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  52.7 
 
 
172 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  49.68 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  48.41 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  44.52 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  48.1 
 
 
173 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  48.75 
 
 
181 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  43.86 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1800  adenine phosphoribosyltransferase  55.7 
 
 
192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160052  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 
171 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  49.66 
 
 
205 aa  137  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
185 aa  137  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 
184 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
172 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
176 aa  137  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  47.88 
 
 
172 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 
184 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
196 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
181 aa  136  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  48.32 
 
 
190 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
179 aa  136  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
180 aa  136  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  48.75 
 
 
181 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1814  adenine phosphoribosyltransferase  48.66 
 
 
188 aa  136  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.068208  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 
194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15120  adenine phosphoribosyltransferase  47.24 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
180 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 
193 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
181 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
181 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
175 aa  135  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0272  adenine phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 
202 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
176 aa  135  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
181 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  44.67 
 
 
180 aa  134  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  47.74 
 
 
178 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0417  adenine phosphoribosyltransferase  49.66 
 
 
231 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  48.68 
 
 
178 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  45.65 
 
 
187 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  55.92 
 
 
185 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  45.1 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  48.68 
 
 
178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1118  adenine phosphoribosyltransferase  45.57 
 
 
182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00971568  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2005  adenine phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 
181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00122085  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14000  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  46 
 
 
172 aa  132  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
188 aa  132  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 
171 aa  132  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  46.98 
 
 
179 aa  132  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1998  adenine phosphoribosyltransferase  56.21 
 
 
183 aa  132  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0411491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 
180 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 
184 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 
172 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  45 
 
 
170 aa  132  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
171 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
172 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  46.05 
 
 
179 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  42.08 
 
 
186 aa  131  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29461  adenine phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 
182 aa  131  5e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.268301  normal  0.53722 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  48 
 
 
424 aa  131  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1375  adenine phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
188 aa  131  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.801683  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1364  adenine phosphoribosyltransferase  47.24 
 
 
178 aa  131  6.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.647458  normal  0.747385 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  44.81 
 
 
179 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  54.62 
 
 
187 aa  130  7.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0603  adenine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0244339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  44.81 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  45.81 
 
 
172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  46.58 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  47.26 
 
 
177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>