More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_29461 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_29461  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
182 aa  355  1.9999999999999998e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.268301  normal  0.53722 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09083  adenine phosphoribosyltransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_7G02310)  56.28 
 
 
214 aa  214  8e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000528084  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  47.9 
 
 
182 aa  160  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
170 aa  159  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  44.89 
 
 
177 aa  157  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  44.58 
 
 
172 aa  156  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  43.2 
 
 
173 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  48.52 
 
 
171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0455  adenine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 
193 aa  150  8.999999999999999e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00282145  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  45.29 
 
 
172 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  45.29 
 
 
172 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_006686  CND05020  adenine phosphoribosyltransferase, putative  48.84 
 
 
178 aa  149  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0435  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
170 aa  149  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0752595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  44.31 
 
 
171 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  44.85 
 
 
187 aa  148  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  43.35 
 
 
172 aa  148  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  41.72 
 
 
172 aa  147  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  48.73 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  44.59 
 
 
424 aa  146  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  47.47 
 
 
173 aa  147  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  46.39 
 
 
172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  43.37 
 
 
170 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  43.6 
 
 
172 aa  146  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  44.05 
 
 
178 aa  145  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
171 aa  144  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  42.69 
 
 
174 aa  144  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 
175 aa  144  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  43.53 
 
 
171 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 
172 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  42.26 
 
 
176 aa  144  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  43.95 
 
 
184 aa  144  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
173 aa  143  1e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0946  adenine phosphoribosyltransferase  42.14 
 
 
171 aa  143  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  43.04 
 
 
172 aa  142  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1005  adenine phosphoribosyltransferase  42.69 
 
 
182 aa  142  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.233001  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  43.86 
 
 
187 aa  142  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0887  adenine phosphoribosyltransferase  42.69 
 
 
182 aa  142  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
173 aa  142  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  46.84 
 
 
172 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  44.94 
 
 
193 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
172 aa  142  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0934  adenine phosphoribosyltransferase  42.69 
 
 
182 aa  141  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.648233  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 
187 aa  141  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 
187 aa  141  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  46.01 
 
 
170 aa  141  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  42.53 
 
 
177 aa  141  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0781  adenine phosphoribosyltransferase  47.56 
 
 
172 aa  141  6e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  42.6 
 
 
172 aa  140  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  45.57 
 
 
173 aa  140  9e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  41.77 
 
 
172 aa  140  9e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  44.91 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  41.92 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  43.53 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  44.77 
 
 
171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  45.28 
 
 
171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  41.25 
 
 
180 aa  138  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 
181 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
185 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  45.28 
 
 
174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  39.29 
 
 
177 aa  138  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  43.04 
 
 
170 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 
181 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
176 aa  137  6e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  41.28 
 
 
181 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  40.94 
 
 
188 aa  137  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
176 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  41.24 
 
 
181 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  44.59 
 
 
198 aa  136  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
173 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0755  Adenine phosphoribosyltransferase  37.57 
 
 
177 aa  137  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  41.24 
 
 
181 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  45.22 
 
 
172 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  45.22 
 
 
172 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  42.01 
 
 
181 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  40.35 
 
 
181 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0545  adenine phosphoribosyltransferase  39.76 
 
 
173 aa  137  1e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.342183  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  40.35 
 
 
180 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  46.91 
 
 
187 aa  137  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3745  adenine phosphoribosyltransferase  43.87 
 
 
181 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  44.16 
 
 
172 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  43.83 
 
 
179 aa  136  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3653  adenine phosphoribosyltransferase  46.43 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  46.58 
 
 
171 aa  135  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  41.07 
 
 
185 aa  135  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2005  adenine phosphoribosyltransferase  38.82 
 
 
181 aa  135  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00122085  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  42.68 
 
 
182 aa  135  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  44.59 
 
 
181 aa  135  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 
180 aa  135  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  41.92 
 
 
171 aa  135  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14000  adenine phosphoribosyltransferase  41.03 
 
 
183 aa  135  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  42.59 
 
 
170 aa  134  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
199 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0821  adenine phosphoribosyltransferase  46.25 
 
 
175 aa  134  8e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1814  adenine phosphoribosyltransferase  41.18 
 
 
188 aa  134  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.068208  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 
183 aa  134  8e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>