More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0834 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0834  putative adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 193 aa  381  1e-105  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0455  adenine phosphoribosyltransferase  59.07 
 
 		 193 aa  237  5.999999999999999e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00282145  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 		 176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09083  adenine phosphoribosyltransferase 1 (AFU_orthologue; AFUA_7G02310)  48.07 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000528084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  45.78 
 
 		 184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 		 172 aa  153  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  47.1 
 
 		 179 aa  153  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 		 172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 		 172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 		 179 aa  151  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  49.07 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  48.45 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  48.45 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  46.43 
 
 		 172 aa  149  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  48.17 
 
 		 178 aa  148  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  46.43 
 
 		 172 aa  147  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1814  adenine phosphoribosyltransferase  41.81 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.068208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0603  adenine phosphoribosyltransferase  47.56 
 
 		 188 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0244339 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0493  adenine phosphoribosyltransferase  46.25 
 
 		 188 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4115  adenine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  44.05 
 
 		 182 aa  145  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0588  adenine phosphoribosyltransferase  46.25 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0772  adenine phosphoribosyltransferase  46.25 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 		 172 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0604  adenine phosphoribosyltransferase  46.25 
 
 		 197 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 		 168 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1004  adenine phosphoribosyltransferase  47.02 
 
 		 172 aa  144  6e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1944  Adenine phosphoribosyltransferase  47.2 
 
 		 186 aa  144  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00976399  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  47.1 
 
 		 178 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 		 175 aa  144  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 		 194 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  43.23 
 
 		 179 aa  144  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1800  adenine phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 		 192 aa  144  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.160052  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  43.64 
 
 		 180 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 		 190 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  43.53 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  46.79 
 
 		 424 aa  143  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  43.79 
 
 		 170 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  42.01 
 
 		 170 aa  142  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  43.53 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0531  adenine phosphoribosyltransferase  45.62 
 
 		 188 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0784653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  44.72 
 
 		 181 aa  141  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0333  adenine phosphoribosyltransferase  46.25 
 
 		 188 aa  141  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  41.92 
 
 		 202 aa  141  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  47.31 
 
 		 173 aa  141  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 		 181 aa  141  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  42.78 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  41.42 
 
 		 170 aa  141  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 		 178 aa  141  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  42.01 
 
 		 170 aa  141  7e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  40.32 
 
 		 186 aa  140  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  44.05 
 
 		 172 aa  140  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 		 177 aa  140  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 		 170 aa  140  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  43.21 
 
 		 181 aa  141  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  42.2 
 
 		 174 aa  140  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0417  adenine phosphoribosyltransferase  41.92 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2318  adenine phosphoribosyltransferase  42.37 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0173481  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2279  adenine phosphoribosyltransferase  42.37 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2326  adenine phosphoribosyltransferase  42.37 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.954374  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  42.5 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 		 205 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  45.81 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  42.5 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  43.2 
 
 		 174 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 		 175 aa  139  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 		 174 aa  139  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2844  adenine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2702  adenine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  42.59 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  44.05 
 
 		 172 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  44.05 
 
 		 172 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0272  adenine phosphoribosyltransferase  41.32 
 
 		 202 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  40.59 
 
 		 179 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2170  adenine phosphoribosyltransferase  45.12 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 		 181 aa  138  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2784  adenine phosphoribosyltransferase  45.12 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  41.21 
 
 		 177 aa  138  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2795  adenine phosphoribosyltransferase  45.12 
 
 		 188 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1998  adenine phosphoribosyltransferase  48.72 
 
 		 183 aa  138  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0411491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6114  adenine phosphoribosyltransferase  45 
 
 		 188 aa  138  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 		 171 aa  137  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  45.29 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0545  adenine phosphoribosyltransferase  44.72 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.342183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  40.7 
 
 		 172 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  42.59 
 
 		 181 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1364  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 		 178 aa  137  7.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.647458  normal  0.747385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 		 170 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  41.4 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  40.74 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>