More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1044 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1044  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
182 aa  366  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1315  adenine phosphoribosyltransferase  73.63 
 
 
182 aa  284  5e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000201282  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1608  adenine phosphoribosyltransferase  73.63 
 
 
182 aa  281  3.0000000000000004e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000613575  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1169  adenine phosphoribosyltransferase  65.38 
 
 
182 aa  255  2e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0215372  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0887  adenine phosphoribosyltransferase  64.29 
 
 
182 aa  250  9.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1005  adenine phosphoribosyltransferase  64.29 
 
 
182 aa  250  9.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.233001  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0934  adenine phosphoribosyltransferase  63.74 
 
 
182 aa  248  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.648233  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1118  adenine phosphoribosyltransferase  63.33 
 
 
182 aa  243  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00971568  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0680  adenine phosphoribosyltransferase  64.25 
 
 
179 aa  239  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0840  adenine phosphoribosyltransferase  63.04 
 
 
185 aa  238  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  52.1 
 
 
181 aa  180  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
181 aa  176  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  47.65 
 
 
181 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
181 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
181 aa  177  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
179 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 
181 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 
199 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 
181 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
179 aa  176  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  49.44 
 
 
180 aa  174  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  50.89 
 
 
181 aa  174  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
186 aa  174  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  52.83 
 
 
179 aa  173  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  51.59 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
180 aa  171  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  54.22 
 
 
170 aa  170  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  46.37 
 
 
181 aa  168  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  52.5 
 
 
172 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  46.3 
 
 
175 aa  167  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  44.58 
 
 
183 aa  165  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
183 aa  164  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
181 aa  164  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  45.18 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 
181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  44.58 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  43.58 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3745  adenine phosphoribosyltransferase  45.25 
 
 
181 aa  162  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
184 aa  162  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  44.58 
 
 
183 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  44.58 
 
 
183 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  44.58 
 
 
183 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  44.58 
 
 
183 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  48.17 
 
 
170 aa  161  4.0000000000000004e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  42.46 
 
 
181 aa  161  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
175 aa  160  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  45.62 
 
 
197 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
193 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  43.5 
 
 
185 aa  159  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
185 aa  159  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
183 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
183 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
182 aa  159  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
183 aa  158  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
181 aa  158  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
181 aa  157  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  41.9 
 
 
181 aa  157  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 
178 aa  157  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  47.2 
 
 
177 aa  157  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
184 aa  157  7e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 
173 aa  157  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 
182 aa  157  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  48.19 
 
 
176 aa  156  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  42.01 
 
 
187 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  45.4 
 
 
181 aa  155  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  45.56 
 
 
183 aa  156  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  46.25 
 
 
182 aa  156  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  42.01 
 
 
187 aa  155  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 
171 aa  155  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 
171 aa  155  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  42.01 
 
 
187 aa  155  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  48.24 
 
 
171 aa  155  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  45 
 
 
185 aa  155  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  47.98 
 
 
172 aa  155  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  45.62 
 
 
184 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  45.62 
 
 
184 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
177 aa  155  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  45.62 
 
 
184 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  45.62 
 
 
184 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  42.17 
 
 
198 aa  155  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  44.97 
 
 
181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  44.31 
 
 
184 aa  154  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
179 aa  154  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 
175 aa  153  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3201  adenine phosphoribosyltransferase  52.45 
 
 
157 aa  153  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.706653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  46.47 
 
 
178 aa  152  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  46.11 
 
 
171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  45.28 
 
 
190 aa  151  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  51.59 
 
 
173 aa  151  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00395  adenine phosphoribosyltransferase  43.86 
 
 
186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  46.25 
 
 
180 aa  150  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>