More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0840 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0840  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
185 aa  378  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1315  adenine phosphoribosyltransferase  64.13 
 
 
182 aa  241  5e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000201282  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1044  adenine phosphoribosyltransferase  63.04 
 
 
182 aa  238  2.9999999999999997e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1608  adenine phosphoribosyltransferase  62.5 
 
 
182 aa  235  3e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000613575  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1169  adenine phosphoribosyltransferase  60.87 
 
 
182 aa  232  2.0000000000000002e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0215372  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0680  adenine phosphoribosyltransferase  62.43 
 
 
179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1118  adenine phosphoribosyltransferase  62.98 
 
 
182 aa  230  9e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00971568  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0887  adenine phosphoribosyltransferase  55.43 
 
 
182 aa  207  5e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1005  adenine phosphoribosyltransferase  55.43 
 
 
182 aa  207  5e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.233001  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0934  adenine phosphoribosyltransferase  54.89 
 
 
182 aa  206  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.648233  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  52.73 
 
 
181 aa  176  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  48.91 
 
 
199 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
179 aa  175  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  56.05 
 
 
181 aa  175  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  52 
 
 
181 aa  174  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  54.78 
 
 
181 aa  174  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  54.78 
 
 
181 aa  174  9e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  50.59 
 
 
181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  55.41 
 
 
181 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 
172 aa  171  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  51.14 
 
 
186 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  48.82 
 
 
181 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
175 aa  170  9e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
181 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  50.91 
 
 
183 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  48.02 
 
 
179 aa  168  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 
179 aa  169  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  50.91 
 
 
183 aa  167  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  50.91 
 
 
183 aa  167  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  50.91 
 
 
183 aa  167  6e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  50.91 
 
 
183 aa  167  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  50.91 
 
 
183 aa  167  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  50.91 
 
 
183 aa  167  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  50.91 
 
 
183 aa  167  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  50.91 
 
 
183 aa  167  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
183 aa  166  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  51.19 
 
 
173 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  52.9 
 
 
179 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  52.44 
 
 
181 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  52.87 
 
 
180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  51.25 
 
 
180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
183 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
183 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
183 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
183 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  44.2 
 
 
177 aa  164  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  51.61 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
181 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  54.9 
 
 
175 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
196 aa  159  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  50.97 
 
 
182 aa  159  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
171 aa  158  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 
171 aa  158  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  52.29 
 
 
170 aa  157  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 
181 aa  157  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  47.19 
 
 
178 aa  157  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  48.28 
 
 
172 aa  157  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
194 aa  156  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 
176 aa  155  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 
171 aa  156  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  52.56 
 
 
185 aa  156  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  49.39 
 
 
197 aa  156  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
182 aa  155  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 
181 aa  155  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  46.29 
 
 
170 aa  155  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
181 aa  155  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  46.43 
 
 
172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  48.3 
 
 
171 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  51.28 
 
 
184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 
185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  50.98 
 
 
168 aa  154  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2795  adenine phosphoribosyltransferase  47.19 
 
 
188 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3745  adenine phosphoribosyltransferase  46.39 
 
 
181 aa  153  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  48.24 
 
 
173 aa  153  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2702  adenine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
188 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2844  adenine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
188 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  44.02 
 
 
185 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6114  adenine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
188 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  47.5 
 
 
198 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  44.94 
 
 
184 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  44.94 
 
 
184 aa  152  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 
185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0531  adenine phosphoribosyltransferase  47.19 
 
 
188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0784653  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  47.9 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  46.59 
 
 
171 aa  151  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
181 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  47.5 
 
 
187 aa  151  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  47.5 
 
 
187 aa  151  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  49.38 
 
 
183 aa  151  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  48.68 
 
 
175 aa  151  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  47.71 
 
 
170 aa  150  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3201  adenine phosphoribosyltransferase  52.86 
 
 
157 aa  150  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.706653  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2170  adenine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
188 aa  150  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2784  adenine phosphoribosyltransferase  46.63 
 
 
188 aa  150  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 
193 aa  150  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0588  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
216 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  49.04 
 
 
180 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>