157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1315 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  100 
 
 		 335 aa  668    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  66.36 
 
 		 329 aa  436  1e-121  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  41.59 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  39.07 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  39.54 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  40.29 
 
 		 344 aa  176  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  40.99 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  34.6 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  33.12 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  38.51 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  32.99 
 
 		 335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  29.93 
 
 		 350 aa  153  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  31.91 
 
 		 284 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  31.69 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  32.5 
 
 		 334 aa  145  8.000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  30.19 
 
 		 345 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  29.35 
 
 		 352 aa  145  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  30.85 
 
 		 282 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  32.03 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  30.22 
 
 		 348 aa  143  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  33.22 
 
 		 335 aa  142  8e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  31.29 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  31.25 
 
 		 346 aa  139  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  31.5 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  30.66 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  28.12 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  30.82 
 
 		 282 aa  127  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  28.36 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  30 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  26.1 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  27.49 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  28.51 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  26.83 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  38.26 
 
 		 212 aa  65.1  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  38.26 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  38.82 
 
 		 173 aa  62  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23960  LSU ribosomal protein L10P  37.35 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  32.29 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  35.23 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  35.14 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  38.55 
 
 		 175 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  36.14 
 
 		 172 aa  57  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 179 aa  57  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 173 aa  57  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  36.56 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  39.74 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  35.96 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  41.86 
 
 		 178 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  33.91 
 
 		 178 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  32.98 
 
 		 181 aa  54.3  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  39.47 
 
 		 184 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  38.1 
 
 		 179 aa  53.1  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  38.1 
 
 		 179 aa  53.1  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  35.9 
 
 		 173 aa  53.1  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 		 174 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  34.48 
 
 		 174 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  37.35 
 
 		 178 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  31.33 
 
 		 181 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  32.14 
 
 		 174 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 174 aa  50.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  35.9 
 
 		 175 aa  50.4  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  33.73 
 
 		 184 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  36.71 
 
 		 190 aa  50.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  29.76 
 
 		 172 aa  50.1  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  35.9 
 
 		 181 aa  49.7  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  34.38 
 
 		 170 aa  49.7  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  32.14 
 
 		 174 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  31.33 
 
 		 202 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0994  50S ribosomal protein L10  34.18 
 
 		 175 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  34.62 
 
 		 181 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  28.72 
 
 		 174 aa  48.9  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  28.97 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0915  ribosomal protein L10  33.73 
 
 		 174 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.690445  normal  0.23712 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 173 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 173 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0966  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 		 175 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.968319  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  35.9 
 
 		 172 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0984  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 		 175 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270382  normal  0.351336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5101  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 		 179 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  35.14 
 
 		 175 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 		 166 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  35.62 
 
 		 175 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  29.03 
 
 		 173 aa  47.8  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  29.81 
 
 		 166 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  32.56 
 
 		 174 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  28.57 
 
 		 174 aa  47  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  28.85 
 
 		 166 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  27.5 
 
 		 172 aa  46.6  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  28.4 
 
 		 180 aa  46.6  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  32.91 
 
 		 166 aa  46.2  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  32.91 
 
 		 166 aa  46.2  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  31.76 
 
 		 182 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  34.48 
 
 		 181 aa  46.2  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  30.68 
 
 		 166 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  30.68 
 
 		 166 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  28.33 
 
 		 172 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3460  50S ribosomal protein L10  29.17 
 
 		 172 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  29.17 
 
 		 172 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  34.94 
 
 		 186 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  30.68 
 
 		 166 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>