40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3519 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  100 
 
 
345 aa  669    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  88.96 
 
 
348 aa  540  9.999999999999999e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  71.66 
 
 
350 aa  442  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  69.78 
 
 
352 aa  437  1e-121  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  72.05 
 
 
345 aa  422  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  40.47 
 
 
346 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  44.67 
 
 
337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  43.96 
 
 
282 aa  228  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  41.94 
 
 
284 aa  228  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  42.7 
 
 
346 aa  225  7e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  43.32 
 
 
282 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  40.07 
 
 
282 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  39.72 
 
 
338 aa  203  5e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  38.39 
 
 
335 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  40.51 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  38.05 
 
 
335 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  37.3 
 
 
336 aa  192  6e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  38.31 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  36.21 
 
 
321 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  31.84 
 
 
294 aa  159  7e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  29.61 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  31.77 
 
 
303 aa  147  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  29.86 
 
 
288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  31.29 
 
 
335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  27.38 
 
 
343 aa  136  5e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  33.87 
 
 
273 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  31.56 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  29.86 
 
 
344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  30.22 
 
 
344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  27.73 
 
 
313 aa  103  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  30.13 
 
 
312 aa  100  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  29.46 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  29.06 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1145  ribosomal protein L10  35 
 
 
182 aa  53.1  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394665  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  36.59 
 
 
176 aa  47.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02830  ribosomal protein, putative  20 
 
 
245 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.463461  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  33.33 
 
 
176 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  25.25 
 
 
220 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  33.06 
 
 
181 aa  43.1  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1703  hypothetical protein  30.38 
 
 
641 aa  42.7  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.57569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>