41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83812 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  100 
 
 		 312 aa  632  1e-180  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  71.79 
 
 		 312 aa  398  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  71.79 
 
 		 312 aa  395  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  48.69 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  48.87 
 
 		 313 aa  262  6e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  29.78 
 
 		 334 aa  124  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  28.52 
 
 		 336 aa  122  6e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  31.08 
 
 		 335 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  29.05 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  29.59 
 
 		 335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  29.45 
 
 		 352 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  29.78 
 
 		 348 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  29.46 
 
 		 350 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  30.28 
 
 		 335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  32.61 
 
 		 345 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  30.97 
 
 		 345 aa  109  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  27.9 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  27.13 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  33.16 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  25 
 
 		 346 aa  97.8  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  31.14 
 
 		 335 aa  97.4  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  27.86 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  26.34 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  29.79 
 
 		 343 aa  90.5  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  25.57 
 
 		 337 aa  89.4  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  26.56 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  29.52 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  22.82 
 
 		 282 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  25.37 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  28.02 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  26.81 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  25.23 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  23.35 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06902  60S acidic ribosomal protein P0, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13470)  25.97 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902791  normal  0.874223 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  24.52 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51641  predicted protein  27.72 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241207 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90212  predicted protein  25.84 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.134219 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 176 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2469  50S ribosomal protein L10  35.87 
 
 		 175 aa  47  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02830  ribosomal protein, putative  22.45 
 
 		 245 aa  47  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.463461  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  27.84 
 
 		 178 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>