34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1262 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  100 
 
 		 335 aa  660    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  94.93 
 
 		 335 aa  615  1e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  97.91 
 
 		 335 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  86.9 
 
 		 336 aa  552  1e-156  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  72.09 
 
 		 338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  44.63 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  44.15 
 
 		 337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  45.07 
 
 		 284 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  41.79 
 
 		 282 aa  220  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  42.45 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  38.67 
 
 		 334 aa  215  9e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  40.48 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  41.16 
 
 		 282 aa  209  7e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  40.6 
 
 		 345 aa  206  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  39.33 
 
 		 352 aa  206  4e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  40.36 
 
 		 282 aa  203  4e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  38.51 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  36.33 
 
 		 348 aa  192  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  33.13 
 
 		 321 aa  175  8e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  36.79 
 
 		 288 aa  161  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  33.22 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  31.97 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  30.66 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  30.8 
 
 		 294 aa  132  6e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  30.51 
 
 		 344 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  30.03 
 
 		 343 aa  113  6e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  31.76 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  30.51 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  29.51 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  30.28 
 
 		 312 aa  102  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  29.51 
 
 		 312 aa  99.4  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  29.1 
 
 		 312 aa  96.7  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  27.89 
 
 		 273 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  19.52 
 
 		 220 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>