39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0655 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  100 
 
 		 282 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  67.97 
 
 		 282 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  67.87 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  64.89 
 
 		 284 aa  383  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  59.22 
 
 		 282 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  51.11 
 
 		 346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  48.91 
 
 		 337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  45.05 
 
 		 350 aa  246  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  42.49 
 
 		 348 aa  228  6e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  43.96 
 
 		 345 aa  228  9e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  43.68 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  40.66 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  41.03 
 
 		 352 aa  223  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  42.12 
 
 		 345 aa  219  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  42.24 
 
 		 336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  41.18 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  39.35 
 
 		 335 aa  201  8e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  41.16 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  35.77 
 
 		 321 aa  165  8e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  33.21 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  33.21 
 
 		 288 aa  152  8e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  30.91 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  32.28 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  30.85 
 
 		 335 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  31.2 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  31.18 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  32 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  31.18 
 
 		 341 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  26.72 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  24.17 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  25.29 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  26.34 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  25.69 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90212  predicted protein  27.43 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.134219 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  20.81 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0640  50S ribosomal protein L10  41.54 
 
 		 169 aa  46.6  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.590803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 176 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1145  ribosomal protein L10  32.53 
 
 		 182 aa  43.5  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394665  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0632  50S ribosomal protein L10  26.42 
 
 		 175 aa  42  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>