37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1580 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  100 
 
 		 282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  64.73 
 
 		 346 aa  362  4e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  63.12 
 
 		 282 aa  360  1e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  59.22 
 
 		 282 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  59.79 
 
 		 284 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  48.38 
 
 		 346 aa  270  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  46.38 
 
 		 337 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  45.09 
 
 		 350 aa  230  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  43.32 
 
 		 345 aa  220  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  43.32 
 
 		 352 aa  218  7.999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  41.52 
 
 		 348 aa  216  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  41.82 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  42.96 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  42.91 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  40.36 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  40 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  38.55 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  40.36 
 
 		 335 aa  188  8e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  35.87 
 
 		 321 aa  152  7e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  33.09 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  33.8 
 
 		 343 aa  137  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  31.73 
 
 		 294 aa  135  8e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  34.8 
 
 		 344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  33.73 
 
 		 344 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  30.82 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  30.77 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  35.71 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  29.04 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  27.75 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  26.43 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  25.11 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  26.87 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  24 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  34.09 
 
 		 212 aa  45.8  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  39.68 
 
 		 176 aa  43.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  24.47 
 
 		 220 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  27.78 
 
 		 173 aa  42.7  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>