35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1600 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  100 
 
 		 344 aa  679    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  80 
 
 		 343 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  75.87 
 
 		 341 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  77.33 
 
 		 344 aa  483  1e-135  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  43.73 
 
 		 303 aa  243  5e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  38.44 
 
 		 329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  39.79 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  38.38 
 
 		 335 aa  169  8e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  31.94 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  30.18 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  33.09 
 
 		 282 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  30.69 
 
 		 348 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  33.22 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  30.69 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  30.43 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  27.71 
 
 		 352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  28.47 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  30.38 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  28.27 
 
 		 346 aa  123  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  31.14 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  29.66 
 
 		 335 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  29.97 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  28.36 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  30.69 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  29.21 
 
 		 338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  26.88 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  26.26 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  27.11 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  29.49 
 
 		 273 aa  82.4  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  27.6 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  29.47 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  28.25 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  26.81 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51641  predicted protein  23.12 
 
 		 255 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241207 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02830  ribosomal protein, putative  23.63 
 
 		 245 aa  52.8  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.463461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>