38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2534 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  100 
 
 		 345 aa  672    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  70.38 
 
 		 352 aa  443  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  72.26 
 
 		 345 aa  426  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  68.45 
 
 		 348 aa  425  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  67.43 
 
 		 350 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  43.73 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  43.66 
 
 		 346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  41.94 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  44.96 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  42.12 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  41.57 
 
 		 282 aa  219  7.999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  40.8 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  42.12 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  42.96 
 
 		 282 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  40 
 
 		 335 aa  212  7e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  40.13 
 
 		 336 aa  212  9e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  38.32 
 
 		 334 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  39.61 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  35.15 
 
 		 321 aa  180  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  30.15 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  30.3 
 
 		 329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  31.94 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  30.04 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  27.5 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  28.78 
 
 		 288 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  34.87 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  32.76 
 
 		 344 aa  122  9e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  29.66 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  27.76 
 
 		 344 aa  113  6e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  32.61 
 
 		 312 aa  100  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  30.71 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  27.59 
 
 		 313 aa  93.6  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  28.51 
 
 		 312 aa  92.4  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  19.65 
 
 		 220 aa  46.2  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06902  60S acidic ribosomal protein P0, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13470)  21.25 
 
 		 246 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902791  normal  0.874223 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  34.52 
 
 		 176 aa  42.7  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl602  50S ribosomal protein L10  31.4 
 
 		 166 aa  42.7  0.009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  33.72 
 
 		 176 aa  42.7  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>