35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0381 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  100 
 
 
288 aa  585  1e-166  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  34.29 
 
 
294 aa  171  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  34.07 
 
 
334 aa  168  8e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  36.43 
 
 
335 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  34.66 
 
 
335 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  36 
 
 
338 aa  158  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  36.79 
 
 
335 aa  152  5e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  33.21 
 
 
282 aa  152  8e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  34.66 
 
 
336 aa  151  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  33.94 
 
 
284 aa  149  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  32.61 
 
 
337 aa  146  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  30.58 
 
 
348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  29.86 
 
 
345 aa  141  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  31.11 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  29.86 
 
 
352 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  30.88 
 
 
282 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  30.58 
 
 
346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  28.27 
 
 
350 aa  132  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  30.77 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  28.32 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  28.78 
 
 
345 aa  126  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  29.43 
 
 
341 aa  126  5e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  28.83 
 
 
346 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  26.33 
 
 
343 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  28.03 
 
 
344 aa  118  9e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  29.21 
 
 
344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  28.36 
 
 
335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  28.68 
 
 
329 aa  115  8.999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  27.69 
 
 
312 aa  95.1  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.734538 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  28.12 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  26.29 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  25.6 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  26.07 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06902  60S acidic ribosomal protein P0, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13470)  21.5 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902791  normal  0.874223 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51641  predicted protein  21.54 
 
 
255 aa  47  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.241207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>