35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0188 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  100 
 
 
338 aa  665    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  71.17 
 
 
336 aa  461  1e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  70.27 
 
 
335 aa  463  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  71.1 
 
 
335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  72.09 
 
 
335 aa  428  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  44.59 
 
 
346 aa  258  7e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  44.48 
 
 
337 aa  251  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  43.05 
 
 
334 aa  231  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  44.09 
 
 
282 aa  231  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  43.31 
 
 
284 aa  231  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  43.68 
 
 
282 aa  227  3e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  42.56 
 
 
346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  38.31 
 
 
350 aa  209  4e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  41.89 
 
 
345 aa  209  5e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  38.24 
 
 
352 aa  209  5e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  41.82 
 
 
282 aa  209  7e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  39.72 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  37.18 
 
 
348 aa  199  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  36.52 
 
 
321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  36 
 
 
288 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  31.69 
 
 
335 aa  147  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  30.86 
 
 
303 aa  135  8e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  32.82 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  29.86 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  29.78 
 
 
343 aa  113  6e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  29.56 
 
 
344 aa  106  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  29.27 
 
 
313 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  28.11 
 
 
344 aa  102  8e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  29.41 
 
 
341 aa  100  5e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  26.8 
 
 
273 aa  100  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  28.28 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  29.08 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  29.51 
 
 
312 aa  97.1  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  20.95 
 
 
220 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51641  predicted protein  20.67 
 
 
255 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.241207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>