33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1420 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  100 
 
 		 321 aa  632  1e-180  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  40.97 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  37.28 
 
 		 346 aa  221  9e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  39.29 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  36.67 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  36.82 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  38.05 
 
 		 352 aa  182  9.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  40.07 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  36.88 
 
 		 284 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  38.18 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  36.49 
 
 		 348 aa  179  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  34.12 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  35.09 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  34.92 
 
 		 345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  34.15 
 
 		 335 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  36.49 
 
 		 345 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  35.77 
 
 		 282 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  33.33 
 
 		 335 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  31.69 
 
 		 329 aa  162  9e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  35.87 
 
 		 282 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  31.62 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  30.97 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  28.31 
 
 		 288 aa  126  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  29.96 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  28.83 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  27.49 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  27.71 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  27.23 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  23.64 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  25.7 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  22.9 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  23.35 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  25.43 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>