34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1414 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  100 
 
 		 335 aa  661    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  94.63 
 
 		 335 aa  593  1e-169  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  94.93 
 
 		 335 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  84.82 
 
 		 336 aa  551  1e-156  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  72.09 
 
 		 338 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  42.76 
 
 		 346 aa  249  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  43.24 
 
 		 337 aa  241  9e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  43.66 
 
 		 284 aa  229  6e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  40.88 
 
 		 350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  38.33 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  41.07 
 
 		 282 aa  215  7e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  41.37 
 
 		 346 aa  212  9e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  39.67 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  40 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  39.35 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  37.42 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  38.93 
 
 		 345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  38.55 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  34.39 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  34.66 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  33.12 
 
 		 335 aa  157  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  31.23 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  29.87 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  30.07 
 
 		 294 aa  132  9e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  29.41 
 
 		 344 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  29.58 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  30.59 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  30.15 
 
 		 344 aa  106  5e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  28.28 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  31.08 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  30.33 
 
 		 312 aa  99.8  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  27.89 
 
 		 273 aa  98.2  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  28.28 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  18.18 
 
 		 220 aa  46.6  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>