42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0414 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  100 
 
 
346 aa  689    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  67.87 
 
 
282 aa  396  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  69.31 
 
 
282 aa  394  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  66.06 
 
 
284 aa  387  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  64.73 
 
 
282 aa  363  3e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  50.52 
 
 
337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  46.65 
 
 
346 aa  288  8e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  42.57 
 
 
350 aa  241  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  45.09 
 
 
334 aa  235  9e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  42.24 
 
 
338 aa  228  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  43.85 
 
 
345 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  41.61 
 
 
348 aa  225  7e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  39.56 
 
 
352 aa  224  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  42.7 
 
 
345 aa  224  2e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  42.11 
 
 
335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  40.53 
 
 
336 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  40.45 
 
 
335 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  41.39 
 
 
335 aa  202  6e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  40.07 
 
 
321 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  34.33 
 
 
303 aa  165  9e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  31.05 
 
 
329 aa  149  8e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  31.91 
 
 
294 aa  147  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  31.25 
 
 
335 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  28.61 
 
 
343 aa  134  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  32.13 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  30.3 
 
 
341 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  28.83 
 
 
288 aa  123  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  29.45 
 
 
344 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  27.13 
 
 
273 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  24.79 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  24.61 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  22.45 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  24.79 
 
 
312 aa  65.1  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90212  predicted protein  22.22 
 
 
232 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.134219 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  19.37 
 
 
220 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  37.08 
 
 
176 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51641  predicted protein  21.79 
 
 
255 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.241207 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0640  50S ribosomal protein L10  38.89 
 
 
169 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.590803  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  35 
 
 
173 aa  43.9  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  28.44 
 
 
174 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02830  ribosomal protein, putative  19.1 
 
 
245 aa  43.5  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.463461  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1038  50S ribosomal protein L10  29.25 
 
 
183 aa  43.1  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>