19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB02830 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB02830  ribosomal protein, putative  100 
 
 		 245 aa  507  1e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.463461  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06902  60S acidic ribosomal protein P0, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13470)  38.8 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902791  normal  0.874223 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90212  predicted protein  32.61 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.134219 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  34.55 
 
 		 220 aa  142  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51641  predicted protein  33.8 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241207 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  23.96 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  25 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  21.31 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  25 
 
 		 343 aa  55.1  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  25.26 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  20.41 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  23.39 
 
 		 344 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  24.37 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  20.69 
 
 		 334 aa  46.2  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  23.58 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  22.04 
 
 		 348 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  20 
 
 		 345 aa  44.3  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  22.39 
 
 		 350 aa  42.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  19.1 
 
 		 346 aa  42  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>