42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1518 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  100 
 
 		 348 aa  677    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  90.88 
 
 		 345 aa  539  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  69.67 
 
 		 352 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  71.94 
 
 		 350 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  69.8 
 
 		 345 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  43.86 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  41.22 
 
 		 284 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  42.27 
 
 		 337 aa  235  8e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  42.49 
 
 		 282 aa  228  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  41.61 
 
 		 346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  41.52 
 
 		 282 aa  216  4e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  38.49 
 
 		 282 aa  210  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  38.69 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  37.67 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  38.33 
 
 		 338 aa  199  7e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  36.12 
 
 		 335 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  36.45 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  36.58 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  36.21 
 
 		 321 aa  179  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  33.09 
 
 		 294 aa  170  4e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  30.32 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  29.18 
 
 		 329 aa  146  7.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  30.58 
 
 		 288 aa  145  9e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  30.22 
 
 		 335 aa  142  9e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  28.44 
 
 		 343 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  32.26 
 
 		 273 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  31.94 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  30.97 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  29.86 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  29.07 
 
 		 312 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  24.4 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  29.78 
 
 		 312 aa  99.8  7e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  29.83 
 
 		 312 aa  97.8  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  36.59 
 
 		 176 aa  51.2  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1145  ribosomal protein L10  31.25 
 
 		 182 aa  49.7  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394665  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  32.14 
 
 		 176 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02830  ribosomal protein, putative  22.04 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.463461  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  23.23 
 
 		 220 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  29.55 
 
 		 166 aa  43.1  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  30.43 
 
 		 179 aa  43.1  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  32.5 
 
 		 166 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  32.5 
 
 		 166 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>