59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2250 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2250  acidic ribosomal protein P0  100 
 
 		 282 aa  565  1e-160  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000108628  normal  0.150308 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0164  acidic ribosomal protein P0  70.11 
 
 		 284 aa  411  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0624484  normal  0.630838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0655  acidic ribosomal protein P0  67.97 
 
 		 282 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00669445  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0414  acidic ribosomal protein P0  69.31 
 
 		 346 aa  394  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1580  acidic ribosomal protein P0  63.12 
 
 		 282 aa  360  1e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000450867  hitchhiker  0.00704406 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1947  acidic ribosomal protein P0  50 
 
 		 337 aa  288  8e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0613  acidic ribosomal protein P0  46.38 
 
 		 346 aa  275  5e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000747442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0255  acidic ribosomal protein P0  44.04 
 
 		 350 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0861  ribosomal protein L10  45.26 
 
 		 334 aa  232  6e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0188  acidic ribosomal protein P0  44.09 
 
 		 338 aa  232  6e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2185  ribosomal protein L10  42.24 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1272  acidic ribosomal protein P0  41.79 
 
 		 336 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0694  acidic ribosomal protein P0  41.43 
 
 		 335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1414  acidic ribosomal protein P0  41.07 
 
 		 335 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2534  acidic ribosomal protein P0  40.66 
 
 		 345 aa  216  5e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.290295 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1518  ribosomal protein L10  39.19 
 
 		 348 aa  210  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3519  ribosomal protein L10  40.66 
 
 		 345 aa  208  7e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0582528  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1262  acidic ribosomal protein P0  41.79 
 
 		 335 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.576197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1420  acidic ribosomal protein P0  38.18 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1754  acidic ribosomal protein P0  32.09 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1636  acidic ribosomal protein P0  33.46 
 
 		 329 aa  149  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1315  ribosomal protein L10  32.03 
 
 		 335 aa  145  9e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0222  acidic ribosomal protein P0  30.83 
 
 		 294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.515044  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0381  acidic ribosomal protein P0  30.88 
 
 		 288 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.767428 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1600  acidic ribosomal protein P0  30.24 
 
 		 344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.127229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0466  acidic ribosomal protein P0  30.77 
 
 		 343 aa  116  5e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.606167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1654  acidic ribosomal protein P0  29.28 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1834  acidic ribosomal protein P0  29.84 
 
 		 344 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.798073 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30660  predicted protein  24.9 
 
 		 273 aa  99.4  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12339  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02734  hypothetical protein similar to 60S acidic ribosomal protein P0 (Broad)  23.79 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.77878 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00300  L10e protein, putative  24.79 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217064  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29307  Cytosolic 80S ribosomal protein P0; Cytosolic 60S large ribosomal subunit protein P0  23.38 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83812  ribosomal protein P0 (A0) (L10E)  22.82 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.734538 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12144  predicted protein  24.06 
 
 		 220 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  34.86 
 
 		 166 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  34.88 
 
 		 176 aa  50.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  36.27 
 
 		 174 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  34.12 
 
 		 178 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0994  50S ribosomal protein L10  34.12 
 
 		 175 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0984  50S ribosomal protein L10  34.12 
 
 		 175 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270382  normal  0.351336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0966  50S ribosomal protein L10  34.12 
 
 		 175 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.968319  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  31.78 
 
 		 166 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0632  50S ribosomal protein L10  28.7 
 
 		 175 aa  46.6  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1038  50S ribosomal protein L10  31.48 
 
 		 183 aa  46.2  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1762  50S ribosomal protein L10  26.47 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  31.68 
 
 		 176 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1738  50S ribosomal protein L10  26.47 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  33.72 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4699  50S ribosomal protein L10  32.46 
 
 		 166 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  hitchhiker  0.00000548606 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  31.78 
 
 		 171 aa  43.9  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  30.23 
 
 		 174 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  28.7 
 
 		 178 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  29.82 
 
 		 167 aa  43.5  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  31.4 
 
 		 173 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  29.67 
 
 		 203 aa  43.1  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2554  50S ribosomal protein L10  30.56 
 
 		 181 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  31.03 
 
 		 175 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5101  50S ribosomal protein L10  30.59 
 
 		 179 aa  42.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1252  50S ribosomal protein L10  30.59 
 
 		 179 aa  42.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268065 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>