More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0100 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
166 aa  325  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  89.76 
 
 
166 aa  295  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  74.1 
 
 
166 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  74.1 
 
 
166 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  74.1 
 
 
166 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  74.1 
 
 
166 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  74.1 
 
 
166 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  74.1 
 
 
166 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  74.1 
 
 
166 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  74.1 
 
 
166 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  74.1 
 
 
166 aa  251  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  74.1 
 
 
166 aa  249  9.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  72.89 
 
 
166 aa  247  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  64.24 
 
 
166 aa  221  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  64.85 
 
 
166 aa  220  9e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  64.85 
 
 
166 aa  220  9e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  64.52 
 
 
171 aa  199  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  61.01 
 
 
170 aa  194  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  59.88 
 
 
167 aa  192  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  60.37 
 
 
166 aa  190  6e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  52.8 
 
 
166 aa  173  9.999999999999999e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  54.78 
 
 
178 aa  169  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  50 
 
 
190 aa  165  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  48.48 
 
 
166 aa  157  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  48.48 
 
 
166 aa  157  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  51.27 
 
 
197 aa  157  5e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  53.74 
 
 
174 aa  152  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  52.74 
 
 
176 aa  150  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  47.31 
 
 
172 aa  149  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  50.31 
 
 
164 aa  148  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  44.77 
 
 
178 aa  148  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  47.4 
 
 
176 aa  148  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  48.48 
 
 
175 aa  147  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  46.75 
 
 
177 aa  141  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  44.08 
 
 
172 aa  137  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  50 
 
 
172 aa  135  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  43.31 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  46.94 
 
 
181 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0617  ribosomal protein L10  45.18 
 
 
166 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4557  50S ribosomal protein L10  45.18 
 
 
166 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.669843  decreased coverage  0.0090203 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  42.01 
 
 
173 aa  132  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5088  50S ribosomal protein L10  44.58 
 
 
166 aa  130  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000128873  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  46.41 
 
 
174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  46.41 
 
 
172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  43.14 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  44.17 
 
 
174 aa  127  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1145  ribosomal protein L10  45.39 
 
 
182 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394665  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  47.06 
 
 
174 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  43.35 
 
 
174 aa  127  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06150  50S ribosomal protein L10  43.98 
 
 
166 aa  127  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  45.1 
 
 
174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  44.44 
 
 
173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  44.44 
 
 
173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08740  50S ribosomal protein L10  43.98 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00037754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0828  50S ribosomal protein L10  43.98 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3918  50S ribosomal protein L10  43.37 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  42 
 
 
174 aa  125  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  42.07 
 
 
168 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  46.53 
 
 
203 aa  124  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  44.03 
 
 
165 aa  124  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0175  50S ribosomal protein L10  44.17 
 
 
165 aa  124  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220587  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  42.94 
 
 
187 aa  124  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4699  50S ribosomal protein L10  43.29 
 
 
166 aa  124  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  hitchhiker  0.00000548606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  41.57 
 
 
168 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  41.57 
 
 
168 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl602  50S ribosomal protein L10  41.03 
 
 
166 aa  124  9e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  41.1 
 
 
173 aa  123  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  46.94 
 
 
183 aa  123  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0445  50S ribosomal protein L10  41.57 
 
 
166 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.470652  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  42.44 
 
 
181 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4758  50S ribosomal protein L10  42.17 
 
 
166 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00494482  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0475  50S ribosomal protein L10  41.57 
 
 
166 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372242  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  40.8 
 
 
174 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  40.8 
 
 
174 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  42.28 
 
 
176 aa  122  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  41.88 
 
 
175 aa  122  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0478  50S ribosomal protein L10  41.98 
 
 
195 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00597987  hitchhiker  0.00527924 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  44.3 
 
 
179 aa  120  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0412  50S ribosomal protein L10P  41.32 
 
 
167 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33563  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  40.94 
 
 
176 aa  119  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  41.26 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  39.13 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  39.64 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  40.96 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  40.99 
 
 
165 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5961  50S ribosomal protein L10  42.59 
 
 
178 aa  118  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  0.892445 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0067  50S ribosomal protein L10  41.56 
 
 
165 aa  118  3e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4771  50S ribosomal protein L10  41.92 
 
 
164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  42.36 
 
 
174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0204  50S ribosomal protein L10  40.85 
 
 
166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000122994  hitchhiker  0.000100039 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  42.76 
 
 
174 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  40.37 
 
 
165 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  41.06 
 
 
173 aa  117  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  40.37 
 
 
165 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4327  50S ribosomal protein L10  42.44 
 
 
181 aa  117  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  40.37 
 
 
165 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0300  ribosomal protein L10  38.15 
 
 
181 aa  117  9e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000817286  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  39.07 
 
 
175 aa  117  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0222  50S ribosomal protein L10  40.85 
 
 
166 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0187  50S ribosomal protein L10  41.46 
 
 
166 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>