More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2554 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2554  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 181 aa  361  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1038  50S ribosomal protein L10  89.71 
 
 		 183 aa  318  1.9999999999999998e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4011  ribosomal protein L10  69.36 
 
 		 175 aa  250  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0274883  hitchhiker  0.0000000471613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  63.84 
 
 		 178 aa  235  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1762  50S ribosomal protein L10  58.6 
 
 		 189 aa  233  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1738  50S ribosomal protein L10  58.6 
 
 		 189 aa  233  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0263  50S ribosomal protein L10  58.51 
 
 		 190 aa  233  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273866  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0632  50S ribosomal protein L10  64.57 
 
 		 175 aa  229  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2469  50S ribosomal protein L10  60.82 
 
 		 175 aa  213  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27791  50S ribosomal protein L10  60.23 
 
 		 175 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02201  50S ribosomal protein L10  59.65 
 
 		 175 aa  207  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.756015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2154  50S ribosomal protein L10  57.06 
 
 		 175 aa  202  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.44563  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02221  50S ribosomal protein L10  54.65 
 
 		 175 aa  199  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0204  50S ribosomal protein L10  54.65 
 
 		 175 aa  198  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02201  50S ribosomal protein L10  54.65 
 
 		 175 aa  198  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.825352  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1569  50S ribosomal protein L10  56 
 
 		 175 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02781  50S ribosomal protein L10  56.89 
 
 		 175 aa  195  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.210657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02311  50S ribosomal protein L10  53.49 
 
 		 175 aa  195  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  41.04 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2331  ribosomal protein L10  41.57 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.910628 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1043  ribosomal protein L10  33.71 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  36.69 
 
 		 172 aa  103  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14715  predicted protein  36.84 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  34.5 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  38.92 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  34.71 
 
 		 172 aa  99.4  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  34.13 
 
 		 172 aa  99.4  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  38.73 
 
 		 202 aa  98.6  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02410  ribosomal protein L10  35.76 
 
 		 173 aa  98.2  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  35.5 
 
 		 256 aa  97.1  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  34.71 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  34.71 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5114  ribosomal protein L10  35.71 
 
 		 175 aa  97.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.316499  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  36.84 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 171 aa  95.9  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  30.23 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  32.95 
 
 		 175 aa  95.1  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  38.51 
 
 		 176 aa  95.1  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0922  50S ribosomal protein L10  34.48 
 
 		 176 aa  95.1  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00116615  hitchhiker  0.00000161737 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  35.39 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  34.3 
 
 		 176 aa  94.4  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  36.48 
 
 		 187 aa  94.7  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  39.08 
 
 		 172 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  34.5 
 
 		 175 aa  94  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  35.9 
 
 		 166 aa  94.4  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  35.26 
 
 		 166 aa  94  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  34.83 
 
 		 166 aa  94  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  34.83 
 
 		 166 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  34.83 
 
 		 166 aa  94  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  34.83 
 
 		 166 aa  94  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  34.83 
 
 		 166 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  32.77 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  34.83 
 
 		 166 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  34.83 
 
 		 166 aa  94  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  34.83 
 
 		 166 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  34.34 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  37.8 
 
 		 175 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 		 166 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  31.98 
 
 		 174 aa  91.7  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  35.76 
 
 		 172 aa  91.7  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  31.25 
 
 		 174 aa  91.3  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  34.55 
 
 		 173 aa  91.3  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1864  50S ribosomal protein L10  31.98 
 
 		 174 aa  90.9  8e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0922754  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0325  50S ribosomal protein L10  31.98 
 
 		 174 aa  90.9  8e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00522529  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  37.93 
 
 		 172 aa  90.5  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  31.79 
 
 		 166 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  37.72 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  36.14 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  36.97 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  35.85 
 
 		 186 aa  89.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  35.88 
 
 		 172 aa  90.1  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  33.73 
 
 		 172 aa  89  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  37.78 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  36.14 
 
 		 173 aa  88.6  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  30.06 
 
 		 174 aa  88.2  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  34.25 
 
 		 166 aa  88.2  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  31.43 
 
 		 177 aa  88.2  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  35.93 
 
 		 172 aa  87.8  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  32.73 
 
 		 174 aa  87.8  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  33.13 
 
 		 174 aa  87.8  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  32.24 
 
 		 168 aa  87.4  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  31.64 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  31.64 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  35.93 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  32.16 
 
 		 173 aa  87  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  34.91 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  35.93 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  34.03 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  35.84 
 
 		 172 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  35.54 
 
 		 172 aa  85.9  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  39.31 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  34.91 
 
 		 172 aa  85.9  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  37.13 
 
 		 172 aa  85.5  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  34.73 
 
 		 174 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4351  ribosomal protein L10  36.08 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>