More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0838 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  100 
 
 		 172 aa  338  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  50.29 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  49.7 
 
 		 174 aa  162  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  46.51 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  48.54 
 
 		 173 aa  160  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  48.54 
 
 		 173 aa  160  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  44.77 
 
 		 172 aa  158  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  49.71 
 
 		 172 aa  158  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  50.87 
 
 		 174 aa  156  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  48.81 
 
 		 174 aa  155  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  48.84 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  46.43 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  46.2 
 
 		 171 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  49.12 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  48.85 
 
 		 173 aa  151  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  48.85 
 
 		 173 aa  151  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  48.21 
 
 		 175 aa  150  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  48.84 
 
 		 174 aa  150  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  44.77 
 
 		 172 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  43.02 
 
 		 171 aa  147  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  49.68 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  46.78 
 
 		 174 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  45.35 
 
 		 195 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  50.67 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  48.15 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  45.61 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  48.21 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0265  50S ribosomal protein L10  45.35 
 
 		 172 aa  141  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  46.51 
 
 		 171 aa  140  8e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  46.67 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2333  50S ribosomal protein L10  48.39 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00442702  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  45.93 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  46.45 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0314  ribosomal protein L10  43.45 
 
 		 175 aa  138  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000329441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  42.42 
 
 		 172 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  44.31 
 
 		 174 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  46.45 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  48.61 
 
 		 173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  43.02 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  42.44 
 
 		 172 aa  137  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  44.77 
 
 		 172 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0175  50S ribosomal protein L10  48.52 
 
 		 165 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  43.02 
 
 		 172 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  46.67 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  43.93 
 
 		 173 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  42.44 
 
 		 172 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  41.86 
 
 		 172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  46.67 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  46.67 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  50 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  42.44 
 
 		 172 aa  134  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  47.52 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  45.24 
 
 		 177 aa  134  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1701  50S ribosomal protein L10  44.77 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0351  50S ribosomal protein L10  44.77 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0337  50S ribosomal protein L10  44.77 
 
 		 171 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.635722  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  44.77 
 
 		 172 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4285  ribosomal protein L10  47.31 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000716484  hitchhiker  0.000000472968 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  42.21 
 
 		 165 aa  134  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  42.51 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1064  50S ribosomal protein L10  48.3 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0220515  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  45.61 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  43.33 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  43.6 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  41.86 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  42.61 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  40.35 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  42.61 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2038  50S ribosomal protein L10  45.09 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0258299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  43.93 
 
 		 189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  41.28 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2544  50S ribosomal protein L10  44.19 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  42.86 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  44.77 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  44.22 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  40.24 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  41.92 
 
 		 175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  44.22 
 
 		 179 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  40.12 
 
 		 172 aa  131  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  43.6 
 
 		 172 aa  131  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2808  50S ribosomal protein L10  45.24 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000036942  normal  0.222423 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3862  50S ribosomal protein L10  45.24 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104786  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0337  50S ribosomal protein L10  45.24 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.239078  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0867  50S ribosomal protein L10  42.26 
 
 		 175 aa  130  9e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  45.33 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  45.56 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  45.45 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0449  50S ribosomal protein L10  43.79 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  46 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  45.45 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3460  50S ribosomal protein L10  44.19 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  47.55 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  46.85 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  46.85 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  46.85 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  46.85 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>