More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0479 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 179 aa  351  2.9999999999999997e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 179 aa  351  2.9999999999999997e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  59.12 
 
 		 180 aa  205  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  55.87 
 
 		 181 aa  195  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0357  50S ribosomal protein L10  43.02 
 
 		 178 aa  136  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.395491  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  42.61 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  42.61 
 
 		 170 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  43.43 
 
 		 177 aa  130  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  42.13 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  40.45 
 
 		 175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  45.71 
 
 		 178 aa  121  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  39.43 
 
 		 181 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  39.66 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  37.64 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  40.68 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  37.08 
 
 		 174 aa  117  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  38.6 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  37.71 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  37.71 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  41.38 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  40.45 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  39.55 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 187 aa  114  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  37.72 
 
 		 173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  35.23 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  40.11 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  35.23 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  36.11 
 
 		 176 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  35.23 
 
 		 174 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 174 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  37.99 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  35.59 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  36.78 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  36 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  37.28 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  36.9 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  34.68 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  34.66 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  38.76 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  37.29 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  36.16 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  34.27 
 
 		 174 aa  105  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  36.16 
 
 		 178 aa  104  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  37.78 
 
 		 175 aa  104  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  34.29 
 
 		 178 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  32.57 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  33.52 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1509  ribosomal protein L10  34.09 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000272992  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  35.8 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  34.83 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  36.26 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  34.57 
 
 		 176 aa  101  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  34.86 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  34.29 
 
 		 181 aa  101  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  36.72 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  36.72 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  36.72 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  36.72 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  36.72 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  36.72 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  36.72 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  36.72 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  35.23 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  38.15 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  36.72 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0578  ribosomal protein L10  38.42 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.141737  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  32 
 
 		 203 aa  99.8  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  36.72 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  35.84 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  32.95 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  34.09 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  36 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  36.72 
 
 		 166 aa  99.4  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  33.33 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  32.02 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  35.75 
 
 		 173 aa  99.4  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  35.2 
 
 		 172 aa  98.2  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  34.5 
 
 		 175 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  34.5 
 
 		 175 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  34.5 
 
 		 172 aa  97.4  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  35.47 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  34.86 
 
 		 171 aa  97.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  33.71 
 
 		 172 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0541  50S ribosomal protein L10  34.83 
 
 		 174 aa  96.7  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367918  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  34.29 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1018  ribosomal protein L10  35.23 
 
 		 202 aa  96.3  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  34.09 
 
 		 171 aa  95.5  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0618  ribosomal protein L10  35.23 
 
 		 173 aa  95.1  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  34.68 
 
 		 195 aa  95.5  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  32.95 
 
 		 172 aa  95.5  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  35.39 
 
 		 173 aa  95.5  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03670  LSU ribosomal protein L10P  38.13 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.692531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  35.62 
 
 		 166 aa  95.5  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  35.62 
 
 		 166 aa  95.5  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  34.86 
 
 		 172 aa  95.1  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  34.29 
 
 		 174 aa  95.1  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>