More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0441 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1453  50S ribosomal protein L10  84.39 
 
 		 173 aa  292  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2994  50S ribosomal protein L10  70.52 
 
 		 173 aa  241  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  63.58 
 
 		 174 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  55.88 
 
 		 172 aa  202  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  56.47 
 
 		 172 aa  191  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  47.4 
 
 		 174 aa  157  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  41.76 
 
 		 173 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  43.93 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  39.41 
 
 		 172 aa  131  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  41.07 
 
 		 172 aa  124  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  38.24 
 
 		 175 aa  121  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 177 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  40.12 
 
 		 174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 174 aa  118  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  38.6 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  35.84 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  35.84 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  38.01 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  37.06 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  38.6 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  33.75 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  34.5 
 
 		 176 aa  108  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  33.72 
 
 		 175 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  38.93 
 
 		 174 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  32.16 
 
 		 176 aa  100  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  34.78 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  36.72 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  34.3 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  36.72 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 173 aa  98.6  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  37.82 
 
 		 174 aa  98.2  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  34.3 
 
 		 170 aa  97.8  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  33.15 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  41.35 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_863  ribosomal protein L10  36.81 
 
 		 176 aa  96.7  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130926  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4011  ribosomal protein L10  34.52 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0274883  hitchhiker  0.0000000471613 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  34.32 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  41.35 
 
 		 174 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1018  50S ribosomal protein L10  37.06 
 
 		 178 aa  95.9  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251564 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 215 aa  95.5  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  37.76 
 
 		 166 aa  95.5  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 173 aa  95.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  35.88 
 
 		 187 aa  95.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  34.13 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2681  50S ribosomal protein L10  30.99 
 
 		 172 aa  94.7  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132453  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  34.42 
 
 		 166 aa  95.1  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  34.42 
 
 		 166 aa  95.1  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  41.38 
 
 		 177 aa  94.7  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  38.3 
 
 		 179 aa  94.7  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  38.89 
 
 		 174 aa  94.7  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0355  50S ribosomal protein L10  30.41 
 
 		 172 aa  94.4  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000413063  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0231  50S ribosomal protein L10  30.41 
 
 		 172 aa  94.4  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103356  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  38.16 
 
 		 174 aa  94  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  38.82 
 
 		 171 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0286  50S ribosomal protein L10  31.4 
 
 		 172 aa  94  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000520195  hitchhiker  0.00386218 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  36 
 
 		 164 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0882  50S ribosomal protein L10  37.18 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.629984  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0991  50S ribosomal protein L10  36.2 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000204805  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  39.85 
 
 		 174 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  35.26 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  37.06 
 
 		 166 aa  92  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  35.81 
 
 		 168 aa  91.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  35.81 
 
 		 168 aa  91.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  38.67 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  37.76 
 
 		 167 aa  91.7  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 178 aa  91.7  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4771  50S ribosomal protein L10  37.59 
 
 		 164 aa  91.3  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  35.48 
 
 		 168 aa  91.3  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1964  50S ribosomal protein L10  27.81 
 
 		 172 aa  90.9  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1072  LSU ribosomal protein L10P  35.62 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  34.87 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  36.78 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  32.2 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4521  ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  31.61 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  31.61 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  31.61 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0140  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 174 aa  89.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1474  50S ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 181 aa  89  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000103472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 168 aa  89  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  34.15 
 
 		 186 aa  88.6  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  32.75 
 
 		 177 aa  88.6  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  32.75 
 
 		 177 aa  88.6  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0179  50S ribosomal protein L10  34.69 
 
 		 161 aa  88.6  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  31.37 
 
 		 165 aa  88.6  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  32.68 
 
 		 165 aa  88.6  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1738  50S ribosomal protein L10  36.55 
 
 		 189 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1762  50S ribosomal protein L10  36.55 
 
 		 189 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0194  50S ribosomal protein L10  28.4 
 
 		 172 aa  88.2  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000548969  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 183 aa  88.2  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 168 aa  88.2  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  41.79 
 
 		 171 aa  88.2  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 168 aa  88.2  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>